Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUH2

Lhx9, LIM/homeobox protein Lhx9, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx9Q9WUH2 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lhx9Q9WUH2 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lhx9Q9WUH2 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lhx9Q9WUH2 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lhx9Q9WUH2 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lhx9Q9WUH2 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lhx9Q9WUH2 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lhx9Q9WUH2 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lhx9Q9WUH2 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lhx9Q9WUH2 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lhx9Q9WUH2 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lhx9Q9WUH2 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lhx9Q9WUH2 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lhx9Q9WUH2 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lhx9Q9WUH2 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lhx9Q9WUH2 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lhx9Q9WUH2 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lhx9Q9WUH2 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lhx9Q9WUH2 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lhx9Q9WUH2 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lhx9Q9WUH2 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lhx9Q9WUH2 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lhx9Q9WUH2 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lhx9Q9WUH2 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lhx9Q9WUH2 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lhx9Q9WUH2 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lhx9Q9WUH2 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lhx9Q9WUH2 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lhx9Q9WUH2 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lhx9Q9WUH2 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lhx9Q9WUH2 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lhx9Q9WUH2 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lhx9Q9WUH2 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lhx9Q9WUH2 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lhx9Q9WUH2 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lhx9Q9WUH2 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lhx9Q9WUH2 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lhx9Q9WUH2 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lhx9Q9WUH2 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lhx9Q9WUH2 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lhx9Q9WUH2 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Lhx9Q9WUH2 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lhx9Q9WUH2 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lhx9Q9WUH2 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lhx9Q9WUH2 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lhx9Q9WUH2 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lhx9Q9WUH2 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Lhx9Q9WUH2 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Lhx9Q9WUH2 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lhx9Q9WUH2 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lhx9Q9WUH2 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lhx9Q9WUH2 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Lhx9Q9WUH2 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lhx9Q9WUH2 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lhx9Q9WUH2 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lhx9Q9WUH2 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lhx9Q9WUH2 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lhx9Q9WUH2 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lhx9Q9WUH2 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Lhx9Q9WUH2 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lhx9Q9WUH2 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lhx9Q9WUH2 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lhx9Q9WUH2 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lhx9Q9WUH2 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lhx9Q9WUH2 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lhx9Q9WUH2 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lhx9Q9WUH2 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lhx9Q9WUH2 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Lhx9Q9WUH2 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lhx9Q9WUH2 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lhx9Q9WUH2 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lhx9Q9WUH2 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lhx9Q9WUH2 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lhx9Q9WUH2 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lhx9Q9WUH2 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lhx9Q9WUH2 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lhx9Q9WUH2 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lhx9Q9WUH2 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lhx9Q9WUH2 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lhx9Q9WUH2 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhx9Q9WUH2 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhx9Q9WUH2 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhx9Q9WUH2 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhx9Q9WUH2 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhx9Q9WUH2 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhx9Q9WUH2 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhx9Q9WUH2 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhx9Q9WUH2 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhx9Q9WUH2 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhx9Q9WUH2 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhx9Q9WUH2 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhx9Q9WUH2 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhx9Q9WUH2 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhx9Q9WUH2 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhx9Q9WUH2 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhx9Q9WUH2 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhx9Q9WUH2 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhx9Q9WUH2 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhx9Q9WUH2 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhx9Q9WUH2 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms