Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU00

Nrf1, Nuclear respiratory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrf1Q9WU00 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nrf1Q9WU00 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nrf1Q9WU00 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nrf1Q9WU00 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nrf1Q9WU00 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nrf1Q9WU00 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nrf1Q9WU00 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nrf1Q9WU00 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nrf1Q9WU00 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Nrf1Q9WU00 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nrf1Q9WU00 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Nrf1Q9WU00 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nrf1Q9WU00 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Nrf1Q9WU00 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nrf1Q9WU00 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nrf1Q9WU00 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nrf1Q9WU00 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nrf1Q9WU00 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nrf1Q9WU00 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nrf1Q9WU00 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nrf1Q9WU00 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nrf1Q9WU00 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nrf1Q9WU00 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nrf1Q9WU00 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nrf1Q9WU00 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nrf1Q9WU00 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nrf1Q9WU00 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nrf1Q9WU00 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nrf1Q9WU00 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Nrf1Q9WU00 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nrf1Q9WU00 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nrf1Q9WU00 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nrf1Q9WU00 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nrf1Q9WU00 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Nrf1Q9WU00 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nrf1Q9WU00 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Nrf1Q9WU00 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nrf1Q9WU00 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nrf1Q9WU00 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nrf1Q9WU00 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nrf1Q9WU00 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nrf1Q9WU00 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nrf1Q9WU00 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nrf1Q9WU00 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nrf1Q9WU00 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nrf1Q9WU00 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nrf1Q9WU00 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nrf1Q9WU00 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nrf1Q9WU00 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nrf1Q9WU00 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nrf1Q9WU00 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nrf1Q9WU00 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nrf1Q9WU00 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nrf1Q9WU00 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nrf1Q9WU00 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nrf1Q9WU00 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nrf1Q9WU00 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nrf1Q9WU00 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nrf1Q9WU00 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Nrf1Q9WU00 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Nrf1Q9WU00 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nrf1Q9WU00 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nrf1Q9WU00 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nrf1Q9WU00 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nrf1Q9WU00 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nrf1Q9WU00 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nrf1Q9WU00 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nrf1Q9WU00 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nrf1Q9WU00 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nrf1Q9WU00 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Nrf1Q9WU00 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nrf1Q9WU00 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nrf1Q9WU00 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nrf1Q9WU00 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nrf1Q9WU00 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nrf1Q9WU00 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nrf1Q9WU00 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nrf1Q9WU00 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nrf1Q9WU00 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nrf1Q9WU00 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nrf1Q9WU00 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nrf1Q9WU00 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nrf1Q9WU00 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nrf1Q9WU00 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nrf1Q9WU00 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nrf1Q9WU00 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nrf1Q9WU00 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nrf1Q9WU00 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nrf1Q9WU00 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nrf1Q9WU00 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nrf1Q9WU00 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nrf1Q9WU00 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nrf1Q9WU00 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nrf1Q9WU00 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nrf1Q9WU00 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nrf1Q9WU00 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nrf1Q9WU00 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nrf1Q9WU00 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nrf1Q9WU00 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nrf1Q9WU00 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms