Protein–RNA interactions for Protein: Q9R269

Ppl, Periplakin, mousemouse

Predictions only

Length 1,755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PplQ9R269 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PplQ9R269 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PplQ9R269 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PplQ9R269 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PplQ9R269 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PplQ9R269 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PplQ9R269 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PplQ9R269 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PplQ9R269 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
PplQ9R269 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PplQ9R269 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PplQ9R269 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PplQ9R269 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PplQ9R269 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PplQ9R269 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PplQ9R269 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PplQ9R269 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PplQ9R269 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PplQ9R269 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PplQ9R269 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PplQ9R269 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PplQ9R269 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PplQ9R269 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PplQ9R269 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PplQ9R269 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PplQ9R269 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PplQ9R269 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PplQ9R269 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PplQ9R269 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PplQ9R269 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PplQ9R269 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PplQ9R269 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PplQ9R269 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PplQ9R269 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PplQ9R269 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PplQ9R269 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PplQ9R269 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PplQ9R269 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PplQ9R269 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PplQ9R269 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PplQ9R269 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PplQ9R269 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PplQ9R269 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PplQ9R269 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PplQ9R269 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PplQ9R269 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PplQ9R269 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PplQ9R269 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PplQ9R269 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PplQ9R269 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PplQ9R269 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PplQ9R269 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PplQ9R269 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PplQ9R269 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PplQ9R269 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PplQ9R269 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PplQ9R269 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PplQ9R269 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PplQ9R269 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PplQ9R269 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PplQ9R269 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PplQ9R269 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PplQ9R269 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PplQ9R269 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PplQ9R269 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PplQ9R269 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PplQ9R269 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PplQ9R269 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PplQ9R269 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PplQ9R269 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PplQ9R269 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PplQ9R269 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PplQ9R269 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PplQ9R269 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PplQ9R269 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PplQ9R269 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PplQ9R269 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PplQ9R269 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
PplQ9R269 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PplQ9R269 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PplQ9R269 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PplQ9R269 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PplQ9R269 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PplQ9R269 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PplQ9R269 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PplQ9R269 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PplQ9R269 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PplQ9R269 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PplQ9R269 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PplQ9R269 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PplQ9R269 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PplQ9R269 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PplQ9R269 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PplQ9R269 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PplQ9R269 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PplQ9R269 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PplQ9R269 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PplQ9R269 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PplQ9R269 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PplQ9R269 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms