Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B6

Lamc3, Laminin subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc3Q9R0B6 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Lamc3Q9R0B6 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Lamc3Q9R0B6 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Lamc3Q9R0B6 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Lamc3Q9R0B6 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Lamc3Q9R0B6 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Lamc3Q9R0B6 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Lamc3Q9R0B6 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Lamc3Q9R0B6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Lamc3Q9R0B6 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Lamc3Q9R0B6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Lamc3Q9R0B6 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Lamc3Q9R0B6 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Lamc3Q9R0B6 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Lamc3Q9R0B6 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Lamc3Q9R0B6 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Lamc3Q9R0B6 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Lamc3Q9R0B6 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Lamc3Q9R0B6 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Lamc3Q9R0B6 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Lamc3Q9R0B6 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Lamc3Q9R0B6 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Lamc3Q9R0B6 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Lamc3Q9R0B6 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Lamc3Q9R0B6 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Lamc3Q9R0B6 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Lamc3Q9R0B6 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Lamc3Q9R0B6 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Lamc3Q9R0B6 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Lamc3Q9R0B6 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Lamc3Q9R0B6 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Lamc3Q9R0B6 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Lamc3Q9R0B6 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Lamc3Q9R0B6 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Lamc3Q9R0B6 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Lamc3Q9R0B6 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Lamc3Q9R0B6 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Lamc3Q9R0B6 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Lamc3Q9R0B6 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Lamc3Q9R0B6 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Lamc3Q9R0B6 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Lamc3Q9R0B6 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Lamc3Q9R0B6 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Lamc3Q9R0B6 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Lamc3Q9R0B6 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Lamc3Q9R0B6 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Lamc3Q9R0B6 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Lamc3Q9R0B6 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Lamc3Q9R0B6 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Lamc3Q9R0B6 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Lamc3Q9R0B6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Lamc3Q9R0B6 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Lamc3Q9R0B6 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Lamc3Q9R0B6 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Lamc3Q9R0B6 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Lamc3Q9R0B6 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Lamc3Q9R0B6 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Lamc3Q9R0B6 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Lamc3Q9R0B6 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Lamc3Q9R0B6 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Lamc3Q9R0B6 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Lamc3Q9R0B6 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Lamc3Q9R0B6 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Lamc3Q9R0B6 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Lamc3Q9R0B6 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Lamc3Q9R0B6 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Lamc3Q9R0B6 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Lamc3Q9R0B6 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Lamc3Q9R0B6 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Lamc3Q9R0B6 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Lamc3Q9R0B6 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Lamc3Q9R0B6 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Lamc3Q9R0B6 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Lamc3Q9R0B6 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Lamc3Q9R0B6 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Lamc3Q9R0B6 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Lamc3Q9R0B6 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Lamc3Q9R0B6 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Lamc3Q9R0B6 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Lamc3Q9R0B6 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Lamc3Q9R0B6 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Lamc3Q9R0B6 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Lamc3Q9R0B6 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Lamc3Q9R0B6 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Lamc3Q9R0B6 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Lamc3Q9R0B6 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Lamc3Q9R0B6 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Lamc3Q9R0B6 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Lamc3Q9R0B6 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Lamc3Q9R0B6 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Lamc3Q9R0B6 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Lamc3Q9R0B6 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Lamc3Q9R0B6 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Lamc3Q9R0B6 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Lamc3Q9R0B6 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Lamc3Q9R0B6 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Lamc3Q9R0B6 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Lamc3Q9R0B6 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Lamc3Q9R0B6 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Lamc3Q9R0B6 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms