Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ0

Npas3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas3Q9QZQ0 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Npas3Q9QZQ0 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Npas3Q9QZQ0 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Npas3Q9QZQ0 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Npas3Q9QZQ0 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Npas3Q9QZQ0 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Npas3Q9QZQ0 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Npas3Q9QZQ0 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Npas3Q9QZQ0 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Npas3Q9QZQ0 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Npas3Q9QZQ0 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Npas3Q9QZQ0 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Npas3Q9QZQ0 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Npas3Q9QZQ0 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Npas3Q9QZQ0 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Npas3Q9QZQ0 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Npas3Q9QZQ0 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Npas3Q9QZQ0 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Npas3Q9QZQ0 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Npas3Q9QZQ0 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Npas3Q9QZQ0 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Npas3Q9QZQ0 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Npas3Q9QZQ0 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Npas3Q9QZQ0 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Npas3Q9QZQ0 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Npas3Q9QZQ0 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Npas3Q9QZQ0 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Npas3Q9QZQ0 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Npas3Q9QZQ0 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Npas3Q9QZQ0 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Npas3Q9QZQ0 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Npas3Q9QZQ0 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Npas3Q9QZQ0 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Npas3Q9QZQ0 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Npas3Q9QZQ0 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Npas3Q9QZQ0 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Npas3Q9QZQ0 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Npas3Q9QZQ0 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Npas3Q9QZQ0 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Npas3Q9QZQ0 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Npas3Q9QZQ0 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Npas3Q9QZQ0 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Npas3Q9QZQ0 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Npas3Q9QZQ0 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Npas3Q9QZQ0 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Npas3Q9QZQ0 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Npas3Q9QZQ0 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Npas3Q9QZQ0 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Npas3Q9QZQ0 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Npas3Q9QZQ0 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Npas3Q9QZQ0 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Npas3Q9QZQ0 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Npas3Q9QZQ0 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Npas3Q9QZQ0 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Npas3Q9QZQ0 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Npas3Q9QZQ0 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Npas3Q9QZQ0 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Npas3Q9QZQ0 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Npas3Q9QZQ0 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Npas3Q9QZQ0 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Npas3Q9QZQ0 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Npas3Q9QZQ0 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Npas3Q9QZQ0 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Npas3Q9QZQ0 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Npas3Q9QZQ0 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Npas3Q9QZQ0 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Npas3Q9QZQ0 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Npas3Q9QZQ0 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Npas3Q9QZQ0 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Npas3Q9QZQ0 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Npas3Q9QZQ0 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Npas3Q9QZQ0 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Npas3Q9QZQ0 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Npas3Q9QZQ0 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Npas3Q9QZQ0 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Npas3Q9QZQ0 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Npas3Q9QZQ0 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Npas3Q9QZQ0 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Npas3Q9QZQ0 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Npas3Q9QZQ0 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Npas3Q9QZQ0 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Npas3Q9QZQ0 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Npas3Q9QZQ0 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Npas3Q9QZQ0 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Npas3Q9QZQ0 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Npas3Q9QZQ0 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Npas3Q9QZQ0 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Npas3Q9QZQ0 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Npas3Q9QZQ0 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Npas3Q9QZQ0 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Npas3Q9QZQ0 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Npas3Q9QZQ0 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Npas3Q9QZQ0 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Npas3Q9QZQ0 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Npas3Q9QZQ0 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Npas3Q9QZQ0 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Npas3Q9QZQ0 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Npas3Q9QZQ0 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Npas3Q9QZQ0 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Npas3Q9QZQ0 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms