Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY80

Hacd1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd1Q9QY80 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hacd1Q9QY80 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hacd1Q9QY80 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hacd1Q9QY80 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hacd1Q9QY80 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hacd1Q9QY80 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hacd1Q9QY80 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hacd1Q9QY80 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hacd1Q9QY80 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hacd1Q9QY80 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hacd1Q9QY80 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hacd1Q9QY80 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hacd1Q9QY80 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hacd1Q9QY80 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Hacd1Q9QY80 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hacd1Q9QY80 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hacd1Q9QY80 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hacd1Q9QY80 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hacd1Q9QY80 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hacd1Q9QY80 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hacd1Q9QY80 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hacd1Q9QY80 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hacd1Q9QY80 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hacd1Q9QY80 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hacd1Q9QY80 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hacd1Q9QY80 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hacd1Q9QY80 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hacd1Q9QY80 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hacd1Q9QY80 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hacd1Q9QY80 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hacd1Q9QY80 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Hacd1Q9QY80 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hacd1Q9QY80 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hacd1Q9QY80 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hacd1Q9QY80 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hacd1Q9QY80 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hacd1Q9QY80 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hacd1Q9QY80 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Hacd1Q9QY80 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hacd1Q9QY80 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hacd1Q9QY80 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hacd1Q9QY80 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hacd1Q9QY80 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hacd1Q9QY80 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hacd1Q9QY80 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hacd1Q9QY80 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hacd1Q9QY80 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hacd1Q9QY80 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hacd1Q9QY80 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hacd1Q9QY80 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hacd1Q9QY80 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hacd1Q9QY80 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hacd1Q9QY80 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hacd1Q9QY80 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hacd1Q9QY80 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hacd1Q9QY80 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hacd1Q9QY80 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hacd1Q9QY80 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hacd1Q9QY80 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hacd1Q9QY80 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Hacd1Q9QY80 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hacd1Q9QY80 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hacd1Q9QY80 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hacd1Q9QY80 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Hacd1Q9QY80 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hacd1Q9QY80 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Hacd1Q9QY80 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hacd1Q9QY80 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hacd1Q9QY80 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hacd1Q9QY80 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hacd1Q9QY80 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hacd1Q9QY80 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hacd1Q9QY80 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hacd1Q9QY80 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hacd1Q9QY80 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hacd1Q9QY80 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hacd1Q9QY80 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hacd1Q9QY80 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hacd1Q9QY80 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hacd1Q9QY80 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hacd1Q9QY80 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hacd1Q9QY80 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hacd1Q9QY80 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hacd1Q9QY80 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hacd1Q9QY80 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hacd1Q9QY80 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hacd1Q9QY80 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hacd1Q9QY80 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hacd1Q9QY80 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hacd1Q9QY80 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hacd1Q9QY80 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hacd1Q9QY80 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hacd1Q9QY80 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hacd1Q9QY80 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hacd1Q9QY80 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Hacd1Q9QY80 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hacd1Q9QY80 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Hacd1Q9QY80 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hacd1Q9QY80 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hacd1Q9QY80 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms