Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ9

Opn4, Melanopsin, mousemouse

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Length 521 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn4Q9QXZ9 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Opn4Q9QXZ9 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Opn4Q9QXZ9 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Opn4Q9QXZ9 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Opn4Q9QXZ9 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Opn4Q9QXZ9 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Opn4Q9QXZ9 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Opn4Q9QXZ9 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Opn4Q9QXZ9 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Opn4Q9QXZ9 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Opn4Q9QXZ9 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Opn4Q9QXZ9 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Opn4Q9QXZ9 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Opn4Q9QXZ9 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Opn4Q9QXZ9 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Opn4Q9QXZ9 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Opn4Q9QXZ9 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Opn4Q9QXZ9 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Opn4Q9QXZ9 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Opn4Q9QXZ9 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Opn4Q9QXZ9 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Opn4Q9QXZ9 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Opn4Q9QXZ9 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Opn4Q9QXZ9 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Opn4Q9QXZ9 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Opn4Q9QXZ9 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Opn4Q9QXZ9 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Opn4Q9QXZ9 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Opn4Q9QXZ9 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Opn4Q9QXZ9 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Opn4Q9QXZ9 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Opn4Q9QXZ9 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Opn4Q9QXZ9 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Opn4Q9QXZ9 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Opn4Q9QXZ9 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Opn4Q9QXZ9 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Opn4Q9QXZ9 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Opn4Q9QXZ9 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Opn4Q9QXZ9 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Opn4Q9QXZ9 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Opn4Q9QXZ9 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Opn4Q9QXZ9 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Opn4Q9QXZ9 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Opn4Q9QXZ9 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Opn4Q9QXZ9 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Opn4Q9QXZ9 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Opn4Q9QXZ9 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Opn4Q9QXZ9 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Opn4Q9QXZ9 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Opn4Q9QXZ9 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Opn4Q9QXZ9 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Opn4Q9QXZ9 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Opn4Q9QXZ9 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Opn4Q9QXZ9 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Opn4Q9QXZ9 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Opn4Q9QXZ9 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Opn4Q9QXZ9 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Opn4Q9QXZ9 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Opn4Q9QXZ9 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Opn4Q9QXZ9 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Opn4Q9QXZ9 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Opn4Q9QXZ9 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Opn4Q9QXZ9 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Opn4Q9QXZ9 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Opn4Q9QXZ9 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Opn4Q9QXZ9 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Opn4Q9QXZ9 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Opn4Q9QXZ9 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Opn4Q9QXZ9 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Opn4Q9QXZ9 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Opn4Q9QXZ9 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Opn4Q9QXZ9 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Opn4Q9QXZ9 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Opn4Q9QXZ9 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Opn4Q9QXZ9 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Opn4Q9QXZ9 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Opn4Q9QXZ9 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Opn4Q9QXZ9 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Opn4Q9QXZ9 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Opn4Q9QXZ9 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Opn4Q9QXZ9 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Opn4Q9QXZ9 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Opn4Q9QXZ9 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Opn4Q9QXZ9 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Opn4Q9QXZ9 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Opn4Q9QXZ9 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Opn4Q9QXZ9 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Opn4Q9QXZ9 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Opn4Q9QXZ9 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Opn4Q9QXZ9 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Opn4Q9QXZ9 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Opn4Q9QXZ9 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Opn4Q9QXZ9 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Opn4Q9QXZ9 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Opn4Q9QXZ9 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Opn4Q9QXZ9 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Opn4Q9QXZ9 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Opn4Q9QXZ9 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Opn4Q9QXZ9 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms