Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV1

Cbx8, Chromobox protein homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx8Q9QXV1 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cbx8Q9QXV1 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cbx8Q9QXV1 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cbx8Q9QXV1 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cbx8Q9QXV1 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cbx8Q9QXV1 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cbx8Q9QXV1 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cbx8Q9QXV1 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cbx8Q9QXV1 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cbx8Q9QXV1 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cbx8Q9QXV1 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cbx8Q9QXV1 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cbx8Q9QXV1 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cbx8Q9QXV1 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cbx8Q9QXV1 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cbx8Q9QXV1 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cbx8Q9QXV1 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cbx8Q9QXV1 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cbx8Q9QXV1 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cbx8Q9QXV1 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cbx8Q9QXV1 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cbx8Q9QXV1 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cbx8Q9QXV1 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cbx8Q9QXV1 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cbx8Q9QXV1 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cbx8Q9QXV1 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cbx8Q9QXV1 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cbx8Q9QXV1 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Cbx8Q9QXV1 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Cbx8Q9QXV1 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cbx8Q9QXV1 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cbx8Q9QXV1 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cbx8Q9QXV1 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cbx8Q9QXV1 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cbx8Q9QXV1 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cbx8Q9QXV1 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cbx8Q9QXV1 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cbx8Q9QXV1 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cbx8Q9QXV1 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cbx8Q9QXV1 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cbx8Q9QXV1 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cbx8Q9QXV1 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cbx8Q9QXV1 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cbx8Q9QXV1 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cbx8Q9QXV1 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cbx8Q9QXV1 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cbx8Q9QXV1 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cbx8Q9QXV1 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cbx8Q9QXV1 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cbx8Q9QXV1 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cbx8Q9QXV1 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Cbx8Q9QXV1 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cbx8Q9QXV1 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cbx8Q9QXV1 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cbx8Q9QXV1 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cbx8Q9QXV1 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cbx8Q9QXV1 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Cbx8Q9QXV1 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cbx8Q9QXV1 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cbx8Q9QXV1 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cbx8Q9QXV1 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cbx8Q9QXV1 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cbx8Q9QXV1 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cbx8Q9QXV1 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cbx8Q9QXV1 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cbx8Q9QXV1 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cbx8Q9QXV1 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cbx8Q9QXV1 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cbx8Q9QXV1 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cbx8Q9QXV1 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Cbx8Q9QXV1 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cbx8Q9QXV1 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cbx8Q9QXV1 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cbx8Q9QXV1 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cbx8Q9QXV1 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cbx8Q9QXV1 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cbx8Q9QXV1 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cbx8Q9QXV1 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Cbx8Q9QXV1 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cbx8Q9QXV1 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cbx8Q9QXV1 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cbx8Q9QXV1 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cbx8Q9QXV1 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cbx8Q9QXV1 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cbx8Q9QXV1 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cbx8Q9QXV1 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Cbx8Q9QXV1 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cbx8Q9QXV1 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cbx8Q9QXV1 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cbx8Q9QXV1 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cbx8Q9QXV1 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cbx8Q9QXV1 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cbx8Q9QXV1 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cbx8Q9QXV1 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cbx8Q9QXV1 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cbx8Q9QXV1 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cbx8Q9QXV1 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cbx8Q9QXV1 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Cbx8Q9QXV1 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cbx8Q9QXV1 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms