Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK7

Cpsf3, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf3Q9QXK7 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cpsf3Q9QXK7 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cpsf3Q9QXK7 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cpsf3Q9QXK7 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cpsf3Q9QXK7 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cpsf3Q9QXK7 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cpsf3Q9QXK7 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cpsf3Q9QXK7 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cpsf3Q9QXK7 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cpsf3Q9QXK7 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cpsf3Q9QXK7 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Cpsf3Q9QXK7 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cpsf3Q9QXK7 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cpsf3Q9QXK7 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cpsf3Q9QXK7 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cpsf3Q9QXK7 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cpsf3Q9QXK7 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cpsf3Q9QXK7 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cpsf3Q9QXK7 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cpsf3Q9QXK7 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cpsf3Q9QXK7 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cpsf3Q9QXK7 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cpsf3Q9QXK7 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cpsf3Q9QXK7 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cpsf3Q9QXK7 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cpsf3Q9QXK7 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cpsf3Q9QXK7 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cpsf3Q9QXK7 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cpsf3Q9QXK7 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cpsf3Q9QXK7 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cpsf3Q9QXK7 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cpsf3Q9QXK7 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cpsf3Q9QXK7 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cpsf3Q9QXK7 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cpsf3Q9QXK7 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cpsf3Q9QXK7 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cpsf3Q9QXK7 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cpsf3Q9QXK7 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cpsf3Q9QXK7 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cpsf3Q9QXK7 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cpsf3Q9QXK7 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cpsf3Q9QXK7 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cpsf3Q9QXK7 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cpsf3Q9QXK7 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cpsf3Q9QXK7 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cpsf3Q9QXK7 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cpsf3Q9QXK7 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cpsf3Q9QXK7 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cpsf3Q9QXK7 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cpsf3Q9QXK7 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cpsf3Q9QXK7 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cpsf3Q9QXK7 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cpsf3Q9QXK7 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cpsf3Q9QXK7 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cpsf3Q9QXK7 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cpsf3Q9QXK7 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cpsf3Q9QXK7 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cpsf3Q9QXK7 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cpsf3Q9QXK7 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cpsf3Q9QXK7 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cpsf3Q9QXK7 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cpsf3Q9QXK7 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cpsf3Q9QXK7 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cpsf3Q9QXK7 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cpsf3Q9QXK7 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cpsf3Q9QXK7 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cpsf3Q9QXK7 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cpsf3Q9QXK7 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cpsf3Q9QXK7 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cpsf3Q9QXK7 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cpsf3Q9QXK7 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cpsf3Q9QXK7 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cpsf3Q9QXK7 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cpsf3Q9QXK7 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cpsf3Q9QXK7 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cpsf3Q9QXK7 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cpsf3Q9QXK7 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cpsf3Q9QXK7 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cpsf3Q9QXK7 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cpsf3Q9QXK7 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cpsf3Q9QXK7 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cpsf3Q9QXK7 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cpsf3Q9QXK7 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Cpsf3Q9QXK7 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cpsf3Q9QXK7 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cpsf3Q9QXK7 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cpsf3Q9QXK7 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cpsf3Q9QXK7 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Cpsf3Q9QXK7 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cpsf3Q9QXK7 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cpsf3Q9QXK7 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cpsf3Q9QXK7 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Cpsf3Q9QXK7 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cpsf3Q9QXK7 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cpsf3Q9QXK7 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cpsf3Q9QXK7 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cpsf3Q9QXK7 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cpsf3Q9QXK7 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cpsf3Q9QXK7 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cpsf3Q9QXK7 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms