Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK2

Rad18, E3 ubiquitin-protein ligase RAD18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad18Q9QXK2 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rad18Q9QXK2 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rad18Q9QXK2 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rad18Q9QXK2 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rad18Q9QXK2 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rad18Q9QXK2 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rad18Q9QXK2 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rad18Q9QXK2 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rad18Q9QXK2 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rad18Q9QXK2 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rad18Q9QXK2 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad18Q9QXK2 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad18Q9QXK2 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad18Q9QXK2 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad18Q9QXK2 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad18Q9QXK2 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad18Q9QXK2 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad18Q9QXK2 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad18Q9QXK2 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad18Q9QXK2 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad18Q9QXK2 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad18Q9QXK2 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad18Q9QXK2 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad18Q9QXK2 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad18Q9QXK2 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad18Q9QXK2 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad18Q9QXK2 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad18Q9QXK2 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad18Q9QXK2 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad18Q9QXK2 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad18Q9QXK2 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad18Q9QXK2 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad18Q9QXK2 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad18Q9QXK2 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad18Q9QXK2 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad18Q9QXK2 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad18Q9QXK2 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad18Q9QXK2 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad18Q9QXK2 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad18Q9QXK2 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad18Q9QXK2 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad18Q9QXK2 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad18Q9QXK2 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad18Q9QXK2 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad18Q9QXK2 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad18Q9QXK2 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad18Q9QXK2 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad18Q9QXK2 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad18Q9QXK2 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad18Q9QXK2 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad18Q9QXK2 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad18Q9QXK2 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad18Q9QXK2 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad18Q9QXK2 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad18Q9QXK2 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad18Q9QXK2 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad18Q9QXK2 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad18Q9QXK2 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad18Q9QXK2 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad18Q9QXK2 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad18Q9QXK2 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad18Q9QXK2 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad18Q9QXK2 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad18Q9QXK2 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad18Q9QXK2 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad18Q9QXK2 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad18Q9QXK2 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rad18Q9QXK2 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rad18Q9QXK2 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rad18Q9QXK2 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rad18Q9QXK2 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rad18Q9QXK2 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rad18Q9QXK2 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rad18Q9QXK2 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rad18Q9QXK2 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rad18Q9QXK2 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rad18Q9QXK2 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rad18Q9QXK2 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rad18Q9QXK2 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rad18Q9QXK2 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rad18Q9QXK2 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rad18Q9QXK2 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rad18Q9QXK2 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rad18Q9QXK2 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rad18Q9QXK2 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rad18Q9QXK2 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rad18Q9QXK2 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rad18Q9QXK2 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rad18Q9QXK2 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rad18Q9QXK2 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rad18Q9QXK2 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rad18Q9QXK2 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rad18Q9QXK2 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rad18Q9QXK2 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rad18Q9QXK2 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rad18Q9QXK2 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rad18Q9QXK2 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rad18Q9QXK2 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rad18Q9QXK2 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rad18Q9QXK2 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms