Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWH1

Phc2, Polyhomeotic-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 850 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phc2Q9QWH1 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Phc2Q9QWH1 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Phc2Q9QWH1 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Phc2Q9QWH1 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Phc2Q9QWH1 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Phc2Q9QWH1 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Phc2Q9QWH1 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Phc2Q9QWH1 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Phc2Q9QWH1 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Phc2Q9QWH1 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Phc2Q9QWH1 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Phc2Q9QWH1 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Phc2Q9QWH1 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Phc2Q9QWH1 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Phc2Q9QWH1 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Phc2Q9QWH1 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Phc2Q9QWH1 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Phc2Q9QWH1 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Phc2Q9QWH1 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Phc2Q9QWH1 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Phc2Q9QWH1 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Phc2Q9QWH1 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Phc2Q9QWH1 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Phc2Q9QWH1 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phc2Q9QWH1 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phc2Q9QWH1 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phc2Q9QWH1 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phc2Q9QWH1 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phc2Q9QWH1 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phc2Q9QWH1 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phc2Q9QWH1 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phc2Q9QWH1 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Phc2Q9QWH1 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phc2Q9QWH1 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phc2Q9QWH1 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phc2Q9QWH1 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phc2Q9QWH1 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Phc2Q9QWH1 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phc2Q9QWH1 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phc2Q9QWH1 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phc2Q9QWH1 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Phc2Q9QWH1 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phc2Q9QWH1 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Phc2Q9QWH1 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phc2Q9QWH1 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phc2Q9QWH1 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phc2Q9QWH1 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phc2Q9QWH1 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phc2Q9QWH1 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Phc2Q9QWH1 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phc2Q9QWH1 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phc2Q9QWH1 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phc2Q9QWH1 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phc2Q9QWH1 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phc2Q9QWH1 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phc2Q9QWH1 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phc2Q9QWH1 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phc2Q9QWH1 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phc2Q9QWH1 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Phc2Q9QWH1 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phc2Q9QWH1 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phc2Q9QWH1 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phc2Q9QWH1 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phc2Q9QWH1 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phc2Q9QWH1 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phc2Q9QWH1 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phc2Q9QWH1 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phc2Q9QWH1 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phc2Q9QWH1 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phc2Q9QWH1 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phc2Q9QWH1 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phc2Q9QWH1 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phc2Q9QWH1 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phc2Q9QWH1 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phc2Q9QWH1 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phc2Q9QWH1 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phc2Q9QWH1 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phc2Q9QWH1 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phc2Q9QWH1 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phc2Q9QWH1 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phc2Q9QWH1 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Phc2Q9QWH1 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phc2Q9QWH1 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phc2Q9QWH1 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phc2Q9QWH1 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phc2Q9QWH1 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phc2Q9QWH1 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phc2Q9QWH1 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phc2Q9QWH1 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phc2Q9QWH1 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phc2Q9QWH1 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phc2Q9QWH1 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phc2Q9QWH1 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phc2Q9QWH1 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phc2Q9QWH1 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Phc2Q9QWH1 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phc2Q9QWH1 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phc2Q9QWH1 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phc2Q9QWH1 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phc2Q9QWH1 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms