Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVY8

Rai2, Retinoic acid-induced protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai2Q9QVY8 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Rai2Q9QVY8 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rai2Q9QVY8 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Rai2Q9QVY8 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rai2Q9QVY8 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Rai2Q9QVY8 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rai2Q9QVY8 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rai2Q9QVY8 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rai2Q9QVY8 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rai2Q9QVY8 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rai2Q9QVY8 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rai2Q9QVY8 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rai2Q9QVY8 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rai2Q9QVY8 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rai2Q9QVY8 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rai2Q9QVY8 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rai2Q9QVY8 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rai2Q9QVY8 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Rai2Q9QVY8 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rai2Q9QVY8 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rai2Q9QVY8 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Rai2Q9QVY8 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Rai2Q9QVY8 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rai2Q9QVY8 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rai2Q9QVY8 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rai2Q9QVY8 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rai2Q9QVY8 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rai2Q9QVY8 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rai2Q9QVY8 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rai2Q9QVY8 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rai2Q9QVY8 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rai2Q9QVY8 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rai2Q9QVY8 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rai2Q9QVY8 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rai2Q9QVY8 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rai2Q9QVY8 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rai2Q9QVY8 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rai2Q9QVY8 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rai2Q9QVY8 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rai2Q9QVY8 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rai2Q9QVY8 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rai2Q9QVY8 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rai2Q9QVY8 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rai2Q9QVY8 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rai2Q9QVY8 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rai2Q9QVY8 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rai2Q9QVY8 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Rai2Q9QVY8 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rai2Q9QVY8 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rai2Q9QVY8 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rai2Q9QVY8 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rai2Q9QVY8 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rai2Q9QVY8 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rai2Q9QVY8 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rai2Q9QVY8 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rai2Q9QVY8 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rai2Q9QVY8 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rai2Q9QVY8 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rai2Q9QVY8 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rai2Q9QVY8 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rai2Q9QVY8 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rai2Q9QVY8 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rai2Q9QVY8 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rai2Q9QVY8 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rai2Q9QVY8 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rai2Q9QVY8 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rai2Q9QVY8 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rai2Q9QVY8 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rai2Q9QVY8 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rai2Q9QVY8 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rai2Q9QVY8 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rai2Q9QVY8 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rai2Q9QVY8 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rai2Q9QVY8 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rai2Q9QVY8 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rai2Q9QVY8 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rai2Q9QVY8 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rai2Q9QVY8 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rai2Q9QVY8 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rai2Q9QVY8 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rai2Q9QVY8 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rai2Q9QVY8 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rai2Q9QVY8 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rai2Q9QVY8 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rai2Q9QVY8 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Rai2Q9QVY8 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rai2Q9QVY8 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rai2Q9QVY8 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rai2Q9QVY8 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rai2Q9QVY8 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rai2Q9QVY8 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rai2Q9QVY8 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rai2Q9QVY8 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rai2Q9QVY8 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rai2Q9QVY8 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rai2Q9QVY8 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rai2Q9QVY8 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rai2Q9QVY8 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rai2Q9QVY8 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rai2Q9QVY8 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms