Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csnk1eQ9JMK2 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csnk1eQ9JMK2 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csnk1eQ9JMK2 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csnk1eQ9JMK2 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csnk1eQ9JMK2 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csnk1eQ9JMK2 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csnk1eQ9JMK2 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csnk1eQ9JMK2 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csnk1eQ9JMK2 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csnk1eQ9JMK2 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csnk1eQ9JMK2 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csnk1eQ9JMK2 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csnk1eQ9JMK2 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csnk1eQ9JMK2 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csnk1eQ9JMK2 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csnk1eQ9JMK2 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csnk1eQ9JMK2 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csnk1eQ9JMK2 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csnk1eQ9JMK2 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csnk1eQ9JMK2 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csnk1eQ9JMK2 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csnk1eQ9JMK2 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csnk1eQ9JMK2 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csnk1eQ9JMK2 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csnk1eQ9JMK2 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csnk1eQ9JMK2 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csnk1eQ9JMK2 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csnk1eQ9JMK2 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csnk1eQ9JMK2 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csnk1eQ9JMK2 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csnk1eQ9JMK2 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csnk1eQ9JMK2 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csnk1eQ9JMK2 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csnk1eQ9JMK2 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csnk1eQ9JMK2 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csnk1eQ9JMK2 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csnk1eQ9JMK2 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Csnk1eQ9JMK2 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csnk1eQ9JMK2 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csnk1eQ9JMK2 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Csnk1eQ9JMK2 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csnk1eQ9JMK2 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csnk1eQ9JMK2 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csnk1eQ9JMK2 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csnk1eQ9JMK2 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Csnk1eQ9JMK2 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Csnk1eQ9JMK2 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Csnk1eQ9JMK2 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Csnk1eQ9JMK2 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Csnk1eQ9JMK2 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Csnk1eQ9JMK2 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Csnk1eQ9JMK2 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csnk1eQ9JMK2 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csnk1eQ9JMK2 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csnk1eQ9JMK2 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csnk1eQ9JMK2 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csnk1eQ9JMK2 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csnk1eQ9JMK2 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csnk1eQ9JMK2 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csnk1eQ9JMK2 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csnk1eQ9JMK2 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Csnk1eQ9JMK2 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csnk1eQ9JMK2 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csnk1eQ9JMK2 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csnk1eQ9JMK2 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csnk1eQ9JMK2 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csnk1eQ9JMK2 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Csnk1eQ9JMK2 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Csnk1eQ9JMK2 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csnk1eQ9JMK2 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Csnk1eQ9JMK2 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csnk1eQ9JMK2 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csnk1eQ9JMK2 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csnk1eQ9JMK2 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csnk1eQ9JMK2 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csnk1eQ9JMK2 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csnk1eQ9JMK2 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Csnk1eQ9JMK2 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csnk1eQ9JMK2 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csnk1eQ9JMK2 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csnk1eQ9JMK2 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csnk1eQ9JMK2 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csnk1eQ9JMK2 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csnk1eQ9JMK2 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csnk1eQ9JMK2 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csnk1eQ9JMK2 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csnk1eQ9JMK2 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Csnk1eQ9JMK2 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csnk1eQ9JMK2 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csnk1eQ9JMK2 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csnk1eQ9JMK2 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csnk1eQ9JMK2 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csnk1eQ9JMK2 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csnk1eQ9JMK2 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csnk1eQ9JMK2 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Csnk1eQ9JMK2 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csnk1eQ9JMK2 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Csnk1eQ9JMK2 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csnk1eQ9JMK2 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms