Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG7

Hdgfl3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Hdgfl3Q9JMG7 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hdgfl3Q9JMG7 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hdgfl3Q9JMG7 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hdgfl3Q9JMG7 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hdgfl3Q9JMG7 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hdgfl3Q9JMG7 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Hdgfl3Q9JMG7 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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