Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ldb3Q9JKS4 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ldb3Q9JKS4 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ldb3Q9JKS4 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ldb3Q9JKS4 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ldb3Q9JKS4 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ldb3Q9JKS4 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Ldb3Q9JKS4 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ldb3Q9JKS4 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ldb3Q9JKS4 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ldb3Q9JKS4 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ldb3Q9JKS4 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ldb3Q9JKS4 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ldb3Q9JKS4 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ldb3Q9JKS4 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ldb3Q9JKS4 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ldb3Q9JKS4 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ldb3Q9JKS4 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ldb3Q9JKS4 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ldb3Q9JKS4 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ldb3Q9JKS4 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ldb3Q9JKS4 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ldb3Q9JKS4 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ldb3Q9JKS4 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ldb3Q9JKS4 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ldb3Q9JKS4 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ldb3Q9JKS4 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ldb3Q9JKS4 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ldb3Q9JKS4 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ldb3Q9JKS4 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ldb3Q9JKS4 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ldb3Q9JKS4 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ldb3Q9JKS4 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ldb3Q9JKS4 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ldb3Q9JKS4 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ldb3Q9JKS4 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ldb3Q9JKS4 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms