Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKN6

Nova1, RNA-binding protein Nova-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nova1Q9JKN6 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nova1Q9JKN6 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nova1Q9JKN6 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nova1Q9JKN6 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nova1Q9JKN6 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nova1Q9JKN6 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nova1Q9JKN6 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nova1Q9JKN6 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nova1Q9JKN6 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nova1Q9JKN6 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nova1Q9JKN6 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nova1Q9JKN6 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nova1Q9JKN6 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nova1Q9JKN6 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nova1Q9JKN6 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nova1Q9JKN6 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nova1Q9JKN6 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nova1Q9JKN6 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nova1Q9JKN6 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nova1Q9JKN6 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nova1Q9JKN6 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nova1Q9JKN6 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nova1Q9JKN6 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nova1Q9JKN6 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nova1Q9JKN6 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nova1Q9JKN6 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nova1Q9JKN6 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nova1Q9JKN6 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nova1Q9JKN6 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nova1Q9JKN6 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nova1Q9JKN6 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nova1Q9JKN6 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nova1Q9JKN6 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nova1Q9JKN6 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nova1Q9JKN6 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nova1Q9JKN6 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nova1Q9JKN6 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nova1Q9JKN6 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nova1Q9JKN6 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nova1Q9JKN6 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nova1Q9JKN6 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nova1Q9JKN6 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nova1Q9JKN6 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nova1Q9JKN6 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nova1Q9JKN6 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nova1Q9JKN6 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nova1Q9JKN6 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nova1Q9JKN6 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nova1Q9JKN6 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nova1Q9JKN6 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nova1Q9JKN6 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nova1Q9JKN6 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nova1Q9JKN6 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Nova1Q9JKN6 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms