Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK8

Atr, Serine/threonine-protein kinase ATR, mousemouse

Predictions only

Length 2,635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrQ9JKK8 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
AtrQ9JKK8 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms