Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF6

Nectin1, Nectin-1, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin1Q9JKF6 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nectin1Q9JKF6 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nectin1Q9JKF6 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nectin1Q9JKF6 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Nectin1Q9JKF6 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nectin1Q9JKF6 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nectin1Q9JKF6 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nectin1Q9JKF6 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nectin1Q9JKF6 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nectin1Q9JKF6 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nectin1Q9JKF6 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nectin1Q9JKF6 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nectin1Q9JKF6 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Nectin1Q9JKF6 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nectin1Q9JKF6 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Nectin1Q9JKF6 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nectin1Q9JKF6 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nectin1Q9JKF6 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nectin1Q9JKF6 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nectin1Q9JKF6 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nectin1Q9JKF6 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nectin1Q9JKF6 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nectin1Q9JKF6 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nectin1Q9JKF6 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nectin1Q9JKF6 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nectin1Q9JKF6 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nectin1Q9JKF6 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nectin1Q9JKF6 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nectin1Q9JKF6 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nectin1Q9JKF6 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nectin1Q9JKF6 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nectin1Q9JKF6 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nectin1Q9JKF6 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nectin1Q9JKF6 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nectin1Q9JKF6 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nectin1Q9JKF6 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nectin1Q9JKF6 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nectin1Q9JKF6 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nectin1Q9JKF6 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nectin1Q9JKF6 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nectin1Q9JKF6 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nectin1Q9JKF6 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nectin1Q9JKF6 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nectin1Q9JKF6 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nectin1Q9JKF6 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nectin1Q9JKF6 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nectin1Q9JKF6 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nectin1Q9JKF6 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nectin1Q9JKF6 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nectin1Q9JKF6 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nectin1Q9JKF6 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Nectin1Q9JKF6 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nectin1Q9JKF6 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nectin1Q9JKF6 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nectin1Q9JKF6 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nectin1Q9JKF6 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nectin1Q9JKF6 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nectin1Q9JKF6 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nectin1Q9JKF6 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nectin1Q9JKF6 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nectin1Q9JKF6 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nectin1Q9JKF6 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nectin1Q9JKF6 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nectin1Q9JKF6 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nectin1Q9JKF6 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nectin1Q9JKF6 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nectin1Q9JKF6 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nectin1Q9JKF6 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nectin1Q9JKF6 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nectin1Q9JKF6 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nectin1Q9JKF6 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nectin1Q9JKF6 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nectin1Q9JKF6 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nectin1Q9JKF6 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nectin1Q9JKF6 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Nectin1Q9JKF6 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nectin1Q9JKF6 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nectin1Q9JKF6 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nectin1Q9JKF6 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nectin1Q9JKF6 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nectin1Q9JKF6 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nectin1Q9JKF6 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nectin1Q9JKF6 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nectin1Q9JKF6 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nectin1Q9JKF6 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nectin1Q9JKF6 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nectin1Q9JKF6 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nectin1Q9JKF6 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nectin1Q9JKF6 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nectin1Q9JKF6 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nectin1Q9JKF6 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nectin1Q9JKF6 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nectin1Q9JKF6 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nectin1Q9JKF6 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nectin1Q9JKF6 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nectin1Q9JKF6 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nectin1Q9JKF6 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nectin1Q9JKF6 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nectin1Q9JKF6 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nectin1Q9JKF6 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms