Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ybx3Q9JKB3 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ybx3Q9JKB3 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ybx3Q9JKB3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ybx3Q9JKB3 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ybx3Q9JKB3 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ybx3Q9JKB3 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ybx3Q9JKB3 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ybx3Q9JKB3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ybx3Q9JKB3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ybx3Q9JKB3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ybx3Q9JKB3 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ybx3Q9JKB3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ybx3Q9JKB3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ybx3Q9JKB3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ybx3Q9JKB3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ybx3Q9JKB3 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ybx3Q9JKB3 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ybx3Q9JKB3 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ybx3Q9JKB3 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ybx3Q9JKB3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ybx3Q9JKB3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ybx3Q9JKB3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ybx3Q9JKB3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ybx3Q9JKB3 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ybx3Q9JKB3 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ybx3Q9JKB3 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ybx3Q9JKB3 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ybx3Q9JKB3 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ybx3Q9JKB3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ybx3Q9JKB3 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ybx3Q9JKB3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ybx3Q9JKB3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ybx3Q9JKB3 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ybx3Q9JKB3 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ybx3Q9JKB3 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ybx3Q9JKB3 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ybx3Q9JKB3 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ybx3Q9JKB3 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ybx3Q9JKB3 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ybx3Q9JKB3 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ybx3Q9JKB3 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ybx3Q9JKB3 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ybx3Q9JKB3 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ybx3Q9JKB3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ybx3Q9JKB3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ybx3Q9JKB3 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ybx3Q9JKB3 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ybx3Q9JKB3 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ybx3Q9JKB3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ybx3Q9JKB3 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ybx3Q9JKB3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ybx3Q9JKB3 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ybx3Q9JKB3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ybx3Q9JKB3 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ybx3Q9JKB3 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ybx3Q9JKB3 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ybx3Q9JKB3 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ybx3Q9JKB3 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ybx3Q9JKB3 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ybx3Q9JKB3 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ybx3Q9JKB3 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ybx3Q9JKB3 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ybx3Q9JKB3 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ybx3Q9JKB3 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ybx3Q9JKB3 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ybx3Q9JKB3 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ybx3Q9JKB3 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ybx3Q9JKB3 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ybx3Q9JKB3 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ybx3Q9JKB3 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ybx3Q9JKB3 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ybx3Q9JKB3 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ybx3Q9JKB3 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ybx3Q9JKB3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ybx3Q9JKB3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ybx3Q9JKB3 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ybx3Q9JKB3 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ybx3Q9JKB3 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ybx3Q9JKB3 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ybx3Q9JKB3 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ybx3Q9JKB3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ybx3Q9JKB3 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ybx3Q9JKB3 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ybx3Q9JKB3 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ybx3Q9JKB3 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ybx3Q9JKB3 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ybx3Q9JKB3 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ybx3Q9JKB3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ybx3Q9JKB3 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ybx3Q9JKB3 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ybx3Q9JKB3 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ybx3Q9JKB3 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ybx3Q9JKB3 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ybx3Q9JKB3 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ybx3Q9JKB3 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ybx3Q9JKB3 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ybx3Q9JKB3 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ybx3Q9JKB3 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ybx3Q9JKB3 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms