Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJS6

Bco1, Beta,beta-carotene 15,15'-dioxygenase, mousemouse

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco1Q9JJS6 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bco1Q9JJS6 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bco1Q9JJS6 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Bco1Q9JJS6 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Bco1Q9JJS6 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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Bco1Q9JJS6 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Bco1Q9JJS6 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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Bco1Q9JJS6 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Bco1Q9JJS6 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Bco1Q9JJS6 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Bco1Q9JJS6 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Bco1Q9JJS6 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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Bco1Q9JJS6 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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Bco1Q9JJS6 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bco1Q9JJS6 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bco1Q9JJS6 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bco1Q9JJS6 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bco1Q9JJS6 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Bco1Q9JJS6 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bco1Q9JJS6 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bco1Q9JJS6 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bco1Q9JJS6 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bco1Q9JJS6 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Bco1Q9JJS6 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bco1Q9JJS6 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bco1Q9JJS6 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bco1Q9JJS6 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bco1Q9JJS6 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Bco1Q9JJS6 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bco1Q9JJS6 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Bco1Q9JJS6 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Bco1Q9JJS6 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Bco1Q9JJS6 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bco1Q9JJS6 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bco1Q9JJS6 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bco1Q9JJS6 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Bco1Q9JJS6 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bco1Q9JJS6 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Bco1Q9JJS6 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bco1Q9JJS6 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bco1Q9JJS6 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bco1Q9JJS6 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bco1Q9JJS6 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bco1Q9JJS6 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bco1Q9JJS6 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bco1Q9JJS6 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bco1Q9JJS6 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bco1Q9JJS6 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bco1Q9JJS6 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bco1Q9JJS6 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bco1Q9JJS6 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bco1Q9JJS6 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bco1Q9JJS6 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bco1Q9JJS6 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bco1Q9JJS6 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bco1Q9JJS6 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bco1Q9JJS6 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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