Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN6

Ctnnbip1, Beta-catenin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnbip1Q9JJN6 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms