Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ80

Rpf2, Ribosome production factor 2 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpf2Q9JJ80 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpf2Q9JJ80 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpf2Q9JJ80 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpf2Q9JJ80 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpf2Q9JJ80 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpf2Q9JJ80 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpf2Q9JJ80 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpf2Q9JJ80 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpf2Q9JJ80 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpf2Q9JJ80 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpf2Q9JJ80 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpf2Q9JJ80 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpf2Q9JJ80 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpf2Q9JJ80 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpf2Q9JJ80 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpf2Q9JJ80 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpf2Q9JJ80 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpf2Q9JJ80 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpf2Q9JJ80 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpf2Q9JJ80 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpf2Q9JJ80 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpf2Q9JJ80 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpf2Q9JJ80 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpf2Q9JJ80 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpf2Q9JJ80 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpf2Q9JJ80 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpf2Q9JJ80 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpf2Q9JJ80 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpf2Q9JJ80 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpf2Q9JJ80 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpf2Q9JJ80 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpf2Q9JJ80 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpf2Q9JJ80 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpf2Q9JJ80 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpf2Q9JJ80 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpf2Q9JJ80 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpf2Q9JJ80 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpf2Q9JJ80 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpf2Q9JJ80 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpf2Q9JJ80 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpf2Q9JJ80 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpf2Q9JJ80 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpf2Q9JJ80 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpf2Q9JJ80 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpf2Q9JJ80 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpf2Q9JJ80 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpf2Q9JJ80 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpf2Q9JJ80 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpf2Q9JJ80 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpf2Q9JJ80 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpf2Q9JJ80 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpf2Q9JJ80 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpf2Q9JJ80 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpf2Q9JJ80 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpf2Q9JJ80 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpf2Q9JJ80 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpf2Q9JJ80 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpf2Q9JJ80 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpf2Q9JJ80 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpf2Q9JJ80 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpf2Q9JJ80 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpf2Q9JJ80 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpf2Q9JJ80 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpf2Q9JJ80 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpf2Q9JJ80 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpf2Q9JJ80 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpf2Q9JJ80 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpf2Q9JJ80 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpf2Q9JJ80 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpf2Q9JJ80 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpf2Q9JJ80 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpf2Q9JJ80 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpf2Q9JJ80 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpf2Q9JJ80 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpf2Q9JJ80 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpf2Q9JJ80 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpf2Q9JJ80 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpf2Q9JJ80 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpf2Q9JJ80 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpf2Q9JJ80 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpf2Q9JJ80 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpf2Q9JJ80 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpf2Q9JJ80 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpf2Q9JJ80 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpf2Q9JJ80 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpf2Q9JJ80 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpf2Q9JJ80 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpf2Q9JJ80 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpf2Q9JJ80 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpf2Q9JJ80 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpf2Q9JJ80 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpf2Q9JJ80 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpf2Q9JJ80 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpf2Q9JJ80 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpf2Q9JJ80 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpf2Q9JJ80 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpf2Q9JJ80 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpf2Q9JJ80 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpf2Q9JJ80 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpf2Q9JJ80 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms