Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI57

Gtf2ird1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird1Q9JI57 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf2ird1Q9JI57 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf2ird1Q9JI57 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf2ird1Q9JI57 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf2ird1Q9JI57 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf2ird1Q9JI57 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf2ird1Q9JI57 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf2ird1Q9JI57 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf2ird1Q9JI57 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf2ird1Q9JI57 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf2ird1Q9JI57 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf2ird1Q9JI57 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf2ird1Q9JI57 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf2ird1Q9JI57 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf2ird1Q9JI57 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf2ird1Q9JI57 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf2ird1Q9JI57 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf2ird1Q9JI57 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf2ird1Q9JI57 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf2ird1Q9JI57 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf2ird1Q9JI57 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf2ird1Q9JI57 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf2ird1Q9JI57 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf2ird1Q9JI57 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf2ird1Q9JI57 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf2ird1Q9JI57 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf2ird1Q9JI57 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf2ird1Q9JI57 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf2ird1Q9JI57 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf2ird1Q9JI57 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf2ird1Q9JI57 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf2ird1Q9JI57 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf2ird1Q9JI57 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf2ird1Q9JI57 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf2ird1Q9JI57 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf2ird1Q9JI57 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf2ird1Q9JI57 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf2ird1Q9JI57 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf2ird1Q9JI57 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf2ird1Q9JI57 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf2ird1Q9JI57 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf2ird1Q9JI57 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf2ird1Q9JI57 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf2ird1Q9JI57 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf2ird1Q9JI57 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf2ird1Q9JI57 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf2ird1Q9JI57 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf2ird1Q9JI57 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf2ird1Q9JI57 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf2ird1Q9JI57 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf2ird1Q9JI57 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf2ird1Q9JI57 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf2ird1Q9JI57 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf2ird1Q9JI57 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf2ird1Q9JI57 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf2ird1Q9JI57 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf2ird1Q9JI57 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf2ird1Q9JI57 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf2ird1Q9JI57 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf2ird1Q9JI57 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf2ird1Q9JI57 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf2ird1Q9JI57 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf2ird1Q9JI57 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf2ird1Q9JI57 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf2ird1Q9JI57 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf2ird1Q9JI57 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf2ird1Q9JI57 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf2ird1Q9JI57 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf2ird1Q9JI57 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf2ird1Q9JI57 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf2ird1Q9JI57 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf2ird1Q9JI57 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf2ird1Q9JI57 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf2ird1Q9JI57 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf2ird1Q9JI57 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gtf2ird1Q9JI57 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gtf2ird1Q9JI57 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gtf2ird1Q9JI57 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gtf2ird1Q9JI57 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gtf2ird1Q9JI57 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gtf2ird1Q9JI57 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gtf2ird1Q9JI57 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gtf2ird1Q9JI57 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Gtf2ird1Q9JI57 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gtf2ird1Q9JI57 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gtf2ird1Q9JI57 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gtf2ird1Q9JI57 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gtf2ird1Q9JI57 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gtf2ird1Q9JI57 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gtf2ird1Q9JI57 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gtf2ird1Q9JI57 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gtf2ird1Q9JI57 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gtf2ird1Q9JI57 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gtf2ird1Q9JI57 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gtf2ird1Q9JI57 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf2ird1Q9JI57 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf2ird1Q9JI57 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf2ird1Q9JI57 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf2ird1Q9JI57 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf2ird1Q9JI57 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms