Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHK4

Rabggta, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtaQ9JHK4 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
RabggtaQ9JHK4 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RabggtaQ9JHK4 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RabggtaQ9JHK4 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RabggtaQ9JHK4 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RabggtaQ9JHK4 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RabggtaQ9JHK4 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RabggtaQ9JHK4 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RabggtaQ9JHK4 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RabggtaQ9JHK4 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RabggtaQ9JHK4 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RabggtaQ9JHK4 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RabggtaQ9JHK4 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RabggtaQ9JHK4 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RabggtaQ9JHK4 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RabggtaQ9JHK4 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RabggtaQ9JHK4 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RabggtaQ9JHK4 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RabggtaQ9JHK4 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RabggtaQ9JHK4 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RabggtaQ9JHK4 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RabggtaQ9JHK4 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RabggtaQ9JHK4 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RabggtaQ9JHK4 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RabggtaQ9JHK4 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RabggtaQ9JHK4 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RabggtaQ9JHK4 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RabggtaQ9JHK4 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RabggtaQ9JHK4 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RabggtaQ9JHK4 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RabggtaQ9JHK4 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RabggtaQ9JHK4 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
RabggtaQ9JHK4 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RabggtaQ9JHK4 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RabggtaQ9JHK4 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RabggtaQ9JHK4 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RabggtaQ9JHK4 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RabggtaQ9JHK4 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RabggtaQ9JHK4 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RabggtaQ9JHK4 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RabggtaQ9JHK4 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RabggtaQ9JHK4 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RabggtaQ9JHK4 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RabggtaQ9JHK4 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RabggtaQ9JHK4 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RabggtaQ9JHK4 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RabggtaQ9JHK4 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RabggtaQ9JHK4 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RabggtaQ9JHK4 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RabggtaQ9JHK4 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC19.77■□□□□ 0.75
RabggtaQ9JHK4 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
RabggtaQ9JHK4 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
RabggtaQ9JHK4 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RabggtaQ9JHK4 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RabggtaQ9JHK4 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RabggtaQ9JHK4 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RabggtaQ9JHK4 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RabggtaQ9JHK4 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RabggtaQ9JHK4 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RabggtaQ9JHK4 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RabggtaQ9JHK4 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RabggtaQ9JHK4 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RabggtaQ9JHK4 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
RabggtaQ9JHK4 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RabggtaQ9JHK4 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RabggtaQ9JHK4 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RabggtaQ9JHK4 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RabggtaQ9JHK4 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RabggtaQ9JHK4 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RabggtaQ9JHK4 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RabggtaQ9JHK4 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RabggtaQ9JHK4 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RabggtaQ9JHK4 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RabggtaQ9JHK4 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RabggtaQ9JHK4 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RabggtaQ9JHK4 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RabggtaQ9JHK4 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RabggtaQ9JHK4 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RabggtaQ9JHK4 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RabggtaQ9JHK4 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RabggtaQ9JHK4 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RabggtaQ9JHK4 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RabggtaQ9JHK4 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RabggtaQ9JHK4 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RabggtaQ9JHK4 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RabggtaQ9JHK4 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
RabggtaQ9JHK4 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RabggtaQ9JHK4 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RabggtaQ9JHK4 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RabggtaQ9JHK4 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RabggtaQ9JHK4 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RabggtaQ9JHK4 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RabggtaQ9JHK4 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RabggtaQ9JHK4 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RabggtaQ9JHK4 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RabggtaQ9JHK4 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RabggtaQ9JHK4 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RabggtaQ9JHK4 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RabggtaQ9JHK4 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RabggtaQ9JHK4 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
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