Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHF5

Tcirg1, V-type proton ATPase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcirg1Q9JHF5 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tcirg1Q9JHF5 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tcirg1Q9JHF5 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tcirg1Q9JHF5 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tcirg1Q9JHF5 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tcirg1Q9JHF5 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tcirg1Q9JHF5 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Tcirg1Q9JHF5 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tcirg1Q9JHF5 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tcirg1Q9JHF5 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tcirg1Q9JHF5 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tcirg1Q9JHF5 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tcirg1Q9JHF5 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tcirg1Q9JHF5 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Tcirg1Q9JHF5 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Tcirg1Q9JHF5 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tcirg1Q9JHF5 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tcirg1Q9JHF5 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tcirg1Q9JHF5 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tcirg1Q9JHF5 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tcirg1Q9JHF5 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tcirg1Q9JHF5 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tcirg1Q9JHF5 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tcirg1Q9JHF5 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tcirg1Q9JHF5 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tcirg1Q9JHF5 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tcirg1Q9JHF5 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Tcirg1Q9JHF5 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tcirg1Q9JHF5 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tcirg1Q9JHF5 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tcirg1Q9JHF5 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tcirg1Q9JHF5 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tcirg1Q9JHF5 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tcirg1Q9JHF5 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tcirg1Q9JHF5 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tcirg1Q9JHF5 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tcirg1Q9JHF5 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tcirg1Q9JHF5 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tcirg1Q9JHF5 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tcirg1Q9JHF5 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Tcirg1Q9JHF5 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Tcirg1Q9JHF5 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Tcirg1Q9JHF5 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Tcirg1Q9JHF5 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Tcirg1Q9JHF5 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Tcirg1Q9JHF5 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tcirg1Q9JHF5 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tcirg1Q9JHF5 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tcirg1Q9JHF5 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tcirg1Q9JHF5 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Tcirg1Q9JHF5 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tcirg1Q9JHF5 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tcirg1Q9JHF5 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tcirg1Q9JHF5 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tcirg1Q9JHF5 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tcirg1Q9JHF5 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tcirg1Q9JHF5 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tcirg1Q9JHF5 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tcirg1Q9JHF5 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tcirg1Q9JHF5 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tcirg1Q9JHF5 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tcirg1Q9JHF5 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tcirg1Q9JHF5 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tcirg1Q9JHF5 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tcirg1Q9JHF5 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tcirg1Q9JHF5 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tcirg1Q9JHF5 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tcirg1Q9JHF5 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tcirg1Q9JHF5 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Tcirg1Q9JHF5 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Tcirg1Q9JHF5 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Tcirg1Q9JHF5 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Tcirg1Q9JHF5 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tcirg1Q9JHF5 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tcirg1Q9JHF5 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tcirg1Q9JHF5 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tcirg1Q9JHF5 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tcirg1Q9JHF5 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tcirg1Q9JHF5 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tcirg1Q9JHF5 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tcirg1Q9JHF5 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tcirg1Q9JHF5 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tcirg1Q9JHF5 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tcirg1Q9JHF5 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tcirg1Q9JHF5 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tcirg1Q9JHF5 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tcirg1Q9JHF5 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tcirg1Q9JHF5 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tcirg1Q9JHF5 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tcirg1Q9JHF5 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tcirg1Q9JHF5 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tcirg1Q9JHF5 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tcirg1Q9JHF5 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tcirg1Q9JHF5 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tcirg1Q9JHF5 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tcirg1Q9JHF5 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tcirg1Q9JHF5 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tcirg1Q9JHF5 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tcirg1Q9JHF5 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tcirg1Q9JHF5 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms