Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET30

Tm9sf3, Transmembrane 9 superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf3Q9ET30 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tm9sf3Q9ET30 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tm9sf3Q9ET30 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tm9sf3Q9ET30 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tm9sf3Q9ET30 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tm9sf3Q9ET30 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tm9sf3Q9ET30 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tm9sf3Q9ET30 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tm9sf3Q9ET30 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tm9sf3Q9ET30 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tm9sf3Q9ET30 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tm9sf3Q9ET30 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tm9sf3Q9ET30 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tm9sf3Q9ET30 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tm9sf3Q9ET30 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tm9sf3Q9ET30 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tm9sf3Q9ET30 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tm9sf3Q9ET30 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tm9sf3Q9ET30 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tm9sf3Q9ET30 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tm9sf3Q9ET30 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tm9sf3Q9ET30 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tm9sf3Q9ET30 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tm9sf3Q9ET30 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tm9sf3Q9ET30 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tm9sf3Q9ET30 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tm9sf3Q9ET30 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tm9sf3Q9ET30 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tm9sf3Q9ET30 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tm9sf3Q9ET30 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tm9sf3Q9ET30 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tm9sf3Q9ET30 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tm9sf3Q9ET30 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tm9sf3Q9ET30 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tm9sf3Q9ET30 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tm9sf3Q9ET30 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Tm9sf3Q9ET30 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tm9sf3Q9ET30 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tm9sf3Q9ET30 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tm9sf3Q9ET30 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tm9sf3Q9ET30 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tm9sf3Q9ET30 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tm9sf3Q9ET30 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tm9sf3Q9ET30 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tm9sf3Q9ET30 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tm9sf3Q9ET30 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tm9sf3Q9ET30 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tm9sf3Q9ET30 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tm9sf3Q9ET30 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tm9sf3Q9ET30 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tm9sf3Q9ET30 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tm9sf3Q9ET30 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tm9sf3Q9ET30 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tm9sf3Q9ET30 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tm9sf3Q9ET30 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tm9sf3Q9ET30 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tm9sf3Q9ET30 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tm9sf3Q9ET30 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tm9sf3Q9ET30 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tm9sf3Q9ET30 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tm9sf3Q9ET30 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tm9sf3Q9ET30 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tm9sf3Q9ET30 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tm9sf3Q9ET30 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tm9sf3Q9ET30 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tm9sf3Q9ET30 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tm9sf3Q9ET30 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tm9sf3Q9ET30 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tm9sf3Q9ET30 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tm9sf3Q9ET30 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tm9sf3Q9ET30 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tm9sf3Q9ET30 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tm9sf3Q9ET30 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tm9sf3Q9ET30 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tm9sf3Q9ET30 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tm9sf3Q9ET30 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tm9sf3Q9ET30 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tm9sf3Q9ET30 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tm9sf3Q9ET30 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tm9sf3Q9ET30 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tm9sf3Q9ET30 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tm9sf3Q9ET30 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tm9sf3Q9ET30 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tm9sf3Q9ET30 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tm9sf3Q9ET30 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tm9sf3Q9ET30 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tm9sf3Q9ET30 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tm9sf3Q9ET30 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tm9sf3Q9ET30 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tm9sf3Q9ET30 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tm9sf3Q9ET30 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tm9sf3Q9ET30 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tm9sf3Q9ET30 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tm9sf3Q9ET30 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tm9sf3Q9ET30 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tm9sf3Q9ET30 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tm9sf3Q9ET30 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tm9sf3Q9ET30 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tm9sf3Q9ET30 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tm9sf3Q9ET30 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms