Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN6

Trim2, Tripartite motif-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim2Q9ESN6 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim2Q9ESN6 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim2Q9ESN6 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim2Q9ESN6 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim2Q9ESN6 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim2Q9ESN6 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim2Q9ESN6 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim2Q9ESN6 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim2Q9ESN6 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim2Q9ESN6 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim2Q9ESN6 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim2Q9ESN6 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim2Q9ESN6 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim2Q9ESN6 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim2Q9ESN6 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim2Q9ESN6 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim2Q9ESN6 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim2Q9ESN6 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim2Q9ESN6 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim2Q9ESN6 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim2Q9ESN6 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim2Q9ESN6 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim2Q9ESN6 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim2Q9ESN6 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim2Q9ESN6 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim2Q9ESN6 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim2Q9ESN6 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim2Q9ESN6 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim2Q9ESN6 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim2Q9ESN6 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim2Q9ESN6 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim2Q9ESN6 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim2Q9ESN6 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim2Q9ESN6 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim2Q9ESN6 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim2Q9ESN6 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim2Q9ESN6 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim2Q9ESN6 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim2Q9ESN6 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim2Q9ESN6 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim2Q9ESN6 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim2Q9ESN6 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim2Q9ESN6 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim2Q9ESN6 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim2Q9ESN6 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim2Q9ESN6 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim2Q9ESN6 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim2Q9ESN6 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim2Q9ESN6 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim2Q9ESN6 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim2Q9ESN6 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim2Q9ESN6 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim2Q9ESN6 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim2Q9ESN6 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim2Q9ESN6 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim2Q9ESN6 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim2Q9ESN6 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim2Q9ESN6 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim2Q9ESN6 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim2Q9ESN6 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim2Q9ESN6 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim2Q9ESN6 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim2Q9ESN6 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim2Q9ESN6 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim2Q9ESN6 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim2Q9ESN6 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim2Q9ESN6 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim2Q9ESN6 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim2Q9ESN6 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim2Q9ESN6 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim2Q9ESN6 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim2Q9ESN6 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim2Q9ESN6 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim2Q9ESN6 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim2Q9ESN6 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim2Q9ESN6 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim2Q9ESN6 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim2Q9ESN6 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim2Q9ESN6 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim2Q9ESN6 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim2Q9ESN6 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim2Q9ESN6 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim2Q9ESN6 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim2Q9ESN6 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim2Q9ESN6 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim2Q9ESN6 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim2Q9ESN6 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim2Q9ESN6 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim2Q9ESN6 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim2Q9ESN6 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim2Q9ESN6 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim2Q9ESN6 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim2Q9ESN6 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim2Q9ESN6 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim2Q9ESN6 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim2Q9ESN6 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim2Q9ESN6 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim2Q9ESN6 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim2Q9ESN6 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim2Q9ESN6 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms