Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESM3

Hapln2, Hyaluronan and proteoglycan link protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hapln2Q9ESM3 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hapln2Q9ESM3 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hapln2Q9ESM3 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hapln2Q9ESM3 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hapln2Q9ESM3 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hapln2Q9ESM3 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hapln2Q9ESM3 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hapln2Q9ESM3 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hapln2Q9ESM3 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hapln2Q9ESM3 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hapln2Q9ESM3 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hapln2Q9ESM3 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hapln2Q9ESM3 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hapln2Q9ESM3 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hapln2Q9ESM3 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hapln2Q9ESM3 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hapln2Q9ESM3 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hapln2Q9ESM3 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hapln2Q9ESM3 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hapln2Q9ESM3 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hapln2Q9ESM3 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hapln2Q9ESM3 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hapln2Q9ESM3 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hapln2Q9ESM3 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hapln2Q9ESM3 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hapln2Q9ESM3 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hapln2Q9ESM3 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hapln2Q9ESM3 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hapln2Q9ESM3 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hapln2Q9ESM3 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hapln2Q9ESM3 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hapln2Q9ESM3 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hapln2Q9ESM3 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hapln2Q9ESM3 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hapln2Q9ESM3 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hapln2Q9ESM3 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hapln2Q9ESM3 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hapln2Q9ESM3 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hapln2Q9ESM3 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hapln2Q9ESM3 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hapln2Q9ESM3 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hapln2Q9ESM3 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Hapln2Q9ESM3 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hapln2Q9ESM3 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hapln2Q9ESM3 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hapln2Q9ESM3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hapln2Q9ESM3 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hapln2Q9ESM3 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hapln2Q9ESM3 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hapln2Q9ESM3 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hapln2Q9ESM3 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hapln2Q9ESM3 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hapln2Q9ESM3 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hapln2Q9ESM3 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hapln2Q9ESM3 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hapln2Q9ESM3 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hapln2Q9ESM3 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hapln2Q9ESM3 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hapln2Q9ESM3 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hapln2Q9ESM3 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hapln2Q9ESM3 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hapln2Q9ESM3 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hapln2Q9ESM3 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hapln2Q9ESM3 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hapln2Q9ESM3 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hapln2Q9ESM3 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hapln2Q9ESM3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hapln2Q9ESM3 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hapln2Q9ESM3 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hapln2Q9ESM3 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hapln2Q9ESM3 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hapln2Q9ESM3 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hapln2Q9ESM3 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hapln2Q9ESM3 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hapln2Q9ESM3 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hapln2Q9ESM3 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hapln2Q9ESM3 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hapln2Q9ESM3 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hapln2Q9ESM3 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hapln2Q9ESM3 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hapln2Q9ESM3 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hapln2Q9ESM3 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hapln2Q9ESM3 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hapln2Q9ESM3 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hapln2Q9ESM3 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hapln2Q9ESM3 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hapln2Q9ESM3 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Hapln2Q9ESM3 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hapln2Q9ESM3 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hapln2Q9ESM3 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hapln2Q9ESM3 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hapln2Q9ESM3 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hapln2Q9ESM3 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hapln2Q9ESM3 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hapln2Q9ESM3 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hapln2Q9ESM3 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hapln2Q9ESM3 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hapln2Q9ESM3 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hapln2Q9ESM3 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hapln2Q9ESM3 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms