Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER42

Barx1, Homeobox protein BarH-like 1, mousemouse

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barx1Q9ER42 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Barx1Q9ER42 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Barx1Q9ER42 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Barx1Q9ER42 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Barx1Q9ER42 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Barx1Q9ER42 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Barx1Q9ER42 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Barx1Q9ER42 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Barx1Q9ER42 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Barx1Q9ER42 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Barx1Q9ER42 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Barx1Q9ER42 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Barx1Q9ER42 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Barx1Q9ER42 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Barx1Q9ER42 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Barx1Q9ER42 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Barx1Q9ER42 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Barx1Q9ER42 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Barx1Q9ER42 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Barx1Q9ER42 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Barx1Q9ER42 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Barx1Q9ER42 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Barx1Q9ER42 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Barx1Q9ER42 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Barx1Q9ER42 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Barx1Q9ER42 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Barx1Q9ER42 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Barx1Q9ER42 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Barx1Q9ER42 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Barx1Q9ER42 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Barx1Q9ER42 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Barx1Q9ER42 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Barx1Q9ER42 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Barx1Q9ER42 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Barx1Q9ER42 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Barx1Q9ER42 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Barx1Q9ER42 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Barx1Q9ER42 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Barx1Q9ER42 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Barx1Q9ER42 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Barx1Q9ER42 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Barx1Q9ER42 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Barx1Q9ER42 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Barx1Q9ER42 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Barx1Q9ER42 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Barx1Q9ER42 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Barx1Q9ER42 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Barx1Q9ER42 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Barx1Q9ER42 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Barx1Q9ER42 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Barx1Q9ER42 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Barx1Q9ER42 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Barx1Q9ER42 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Barx1Q9ER42 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Barx1Q9ER42 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Barx1Q9ER42 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Barx1Q9ER42 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Barx1Q9ER42 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Barx1Q9ER42 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Barx1Q9ER42 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Barx1Q9ER42 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Barx1Q9ER42 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Barx1Q9ER42 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Barx1Q9ER42 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Barx1Q9ER42 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Barx1Q9ER42 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Barx1Q9ER42 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Barx1Q9ER42 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Barx1Q9ER42 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Barx1Q9ER42 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Barx1Q9ER42 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Barx1Q9ER42 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Barx1Q9ER42 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Barx1Q9ER42 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Barx1Q9ER42 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Barx1Q9ER42 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Barx1Q9ER42 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Barx1Q9ER42 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Barx1Q9ER42 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Barx1Q9ER42 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Barx1Q9ER42 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Barx1Q9ER42 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Barx1Q9ER42 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Barx1Q9ER42 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Barx1Q9ER42 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Barx1Q9ER42 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Barx1Q9ER42 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Barx1Q9ER42 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Barx1Q9ER42 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Barx1Q9ER42 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Barx1Q9ER42 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Barx1Q9ER42 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Barx1Q9ER42 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Barx1Q9ER42 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Barx1Q9ER42 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Barx1Q9ER42 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Barx1Q9ER42 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Barx1Q9ER42 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Barx1Q9ER42 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Barx1Q9ER42 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.5 ms