Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SgshQ9EQ08 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SgshQ9EQ08 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SgshQ9EQ08 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SgshQ9EQ08 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SgshQ9EQ08 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SgshQ9EQ08 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SgshQ9EQ08 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SgshQ9EQ08 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SgshQ9EQ08 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SgshQ9EQ08 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SgshQ9EQ08 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SgshQ9EQ08 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SgshQ9EQ08 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SgshQ9EQ08 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SgshQ9EQ08 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SgshQ9EQ08 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SgshQ9EQ08 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SgshQ9EQ08 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SgshQ9EQ08 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SgshQ9EQ08 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SgshQ9EQ08 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SgshQ9EQ08 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SgshQ9EQ08 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SgshQ9EQ08 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SgshQ9EQ08 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SgshQ9EQ08 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SgshQ9EQ08 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SgshQ9EQ08 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SgshQ9EQ08 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SgshQ9EQ08 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SgshQ9EQ08 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SgshQ9EQ08 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SgshQ9EQ08 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SgshQ9EQ08 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SgshQ9EQ08 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SgshQ9EQ08 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SgshQ9EQ08 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SgshQ9EQ08 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SgshQ9EQ08 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SgshQ9EQ08 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SgshQ9EQ08 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SgshQ9EQ08 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SgshQ9EQ08 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SgshQ9EQ08 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SgshQ9EQ08 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SgshQ9EQ08 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SgshQ9EQ08 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SgshQ9EQ08 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SgshQ9EQ08 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SgshQ9EQ08 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SgshQ9EQ08 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SgshQ9EQ08 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SgshQ9EQ08 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SgshQ9EQ08 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SgshQ9EQ08 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SgshQ9EQ08 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SgshQ9EQ08 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SgshQ9EQ08 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SgshQ9EQ08 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SgshQ9EQ08 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SgshQ9EQ08 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SgshQ9EQ08 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SgshQ9EQ08 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SgshQ9EQ08 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SgshQ9EQ08 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SgshQ9EQ08 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SgshQ9EQ08 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SgshQ9EQ08 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SgshQ9EQ08 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SgshQ9EQ08 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SgshQ9EQ08 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SgshQ9EQ08 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SgshQ9EQ08 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SgshQ9EQ08 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SgshQ9EQ08 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SgshQ9EQ08 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SgshQ9EQ08 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SgshQ9EQ08 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SgshQ9EQ08 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
SgshQ9EQ08 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SgshQ9EQ08 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SgshQ9EQ08 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SgshQ9EQ08 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
SgshQ9EQ08 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SgshQ9EQ08 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SgshQ9EQ08 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SgshQ9EQ08 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SgshQ9EQ08 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SgshQ9EQ08 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SgshQ9EQ08 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SgshQ9EQ08 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SgshQ9EQ08 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SgshQ9EQ08 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SgshQ9EQ08 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SgshQ9EQ08 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SgshQ9EQ08 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SgshQ9EQ08 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SgshQ9EQ08 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SgshQ9EQ08 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms