Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPK2

Rp2, Protein XRP2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rp2Q9EPK2 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rp2Q9EPK2 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rp2Q9EPK2 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rp2Q9EPK2 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rp2Q9EPK2 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rp2Q9EPK2 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rp2Q9EPK2 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rp2Q9EPK2 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rp2Q9EPK2 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rp2Q9EPK2 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rp2Q9EPK2 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rp2Q9EPK2 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rp2Q9EPK2 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rp2Q9EPK2 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rp2Q9EPK2 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rp2Q9EPK2 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rp2Q9EPK2 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rp2Q9EPK2 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rp2Q9EPK2 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rp2Q9EPK2 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rp2Q9EPK2 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rp2Q9EPK2 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rp2Q9EPK2 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rp2Q9EPK2 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rp2Q9EPK2 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rp2Q9EPK2 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rp2Q9EPK2 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rp2Q9EPK2 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rp2Q9EPK2 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rp2Q9EPK2 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rp2Q9EPK2 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rp2Q9EPK2 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rp2Q9EPK2 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rp2Q9EPK2 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rp2Q9EPK2 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rp2Q9EPK2 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rp2Q9EPK2 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rp2Q9EPK2 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rp2Q9EPK2 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rp2Q9EPK2 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rp2Q9EPK2 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rp2Q9EPK2 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rp2Q9EPK2 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rp2Q9EPK2 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rp2Q9EPK2 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rp2Q9EPK2 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rp2Q9EPK2 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rp2Q9EPK2 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rp2Q9EPK2 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rp2Q9EPK2 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rp2Q9EPK2 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rp2Q9EPK2 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rp2Q9EPK2 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rp2Q9EPK2 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rp2Q9EPK2 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rp2Q9EPK2 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rp2Q9EPK2 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rp2Q9EPK2 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rp2Q9EPK2 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rp2Q9EPK2 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rp2Q9EPK2 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rp2Q9EPK2 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rp2Q9EPK2 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rp2Q9EPK2 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rp2Q9EPK2 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rp2Q9EPK2 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rp2Q9EPK2 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rp2Q9EPK2 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rp2Q9EPK2 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rp2Q9EPK2 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rp2Q9EPK2 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rp2Q9EPK2 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rp2Q9EPK2 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rp2Q9EPK2 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rp2Q9EPK2 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rp2Q9EPK2 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rp2Q9EPK2 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rp2Q9EPK2 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rp2Q9EPK2 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rp2Q9EPK2 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rp2Q9EPK2 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rp2Q9EPK2 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rp2Q9EPK2 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rp2Q9EPK2 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rp2Q9EPK2 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rp2Q9EPK2 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rp2Q9EPK2 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rp2Q9EPK2 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rp2Q9EPK2 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rp2Q9EPK2 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rp2Q9EPK2 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rp2Q9EPK2 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rp2Q9EPK2 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rp2Q9EPK2 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rp2Q9EPK2 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rp2Q9EPK2 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rp2Q9EPK2 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rp2Q9EPK2 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rp2Q9EPK2 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rp2Q9EPK2 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms