Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rnft1Q9DCN7 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rnft1Q9DCN7 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rnft1Q9DCN7 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rnft1Q9DCN7 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rnft1Q9DCN7 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rnft1Q9DCN7 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnft1Q9DCN7 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnft1Q9DCN7 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnft1Q9DCN7 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnft1Q9DCN7 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnft1Q9DCN7 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnft1Q9DCN7 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnft1Q9DCN7 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnft1Q9DCN7 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnft1Q9DCN7 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnft1Q9DCN7 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnft1Q9DCN7 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnft1Q9DCN7 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnft1Q9DCN7 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnft1Q9DCN7 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnft1Q9DCN7 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnft1Q9DCN7 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnft1Q9DCN7 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnft1Q9DCN7 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnft1Q9DCN7 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnft1Q9DCN7 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnft1Q9DCN7 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnft1Q9DCN7 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnft1Q9DCN7 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnft1Q9DCN7 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnft1Q9DCN7 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnft1Q9DCN7 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnft1Q9DCN7 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnft1Q9DCN7 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnft1Q9DCN7 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnft1Q9DCN7 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnft1Q9DCN7 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnft1Q9DCN7 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnft1Q9DCN7 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnft1Q9DCN7 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnft1Q9DCN7 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnft1Q9DCN7 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnft1Q9DCN7 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnft1Q9DCN7 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnft1Q9DCN7 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnft1Q9DCN7 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnft1Q9DCN7 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnft1Q9DCN7 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnft1Q9DCN7 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnft1Q9DCN7 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnft1Q9DCN7 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnft1Q9DCN7 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnft1Q9DCN7 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnft1Q9DCN7 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnft1Q9DCN7 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnft1Q9DCN7 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnft1Q9DCN7 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnft1Q9DCN7 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnft1Q9DCN7 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnft1Q9DCN7 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnft1Q9DCN7 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnft1Q9DCN7 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnft1Q9DCN7 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnft1Q9DCN7 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnft1Q9DCN7 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnft1Q9DCN7 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnft1Q9DCN7 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnft1Q9DCN7 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnft1Q9DCN7 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnft1Q9DCN7 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnft1Q9DCN7 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnft1Q9DCN7 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnft1Q9DCN7 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnft1Q9DCN7 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnft1Q9DCN7 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnft1Q9DCN7 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnft1Q9DCN7 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnft1Q9DCN7 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnft1Q9DCN7 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnft1Q9DCN7 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnft1Q9DCN7 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnft1Q9DCN7 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnft1Q9DCN7 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnft1Q9DCN7 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnft1Q9DCN7 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnft1Q9DCN7 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnft1Q9DCN7 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnft1Q9DCN7 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnft1Q9DCN7 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnft1Q9DCN7 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnft1Q9DCN7 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnft1Q9DCN7 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnft1Q9DCN7 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnft1Q9DCN7 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnft1Q9DCN7 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnft1Q9DCN7 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnft1Q9DCN7 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnft1Q9DCN7 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnft1Q9DCN7 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms