Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCB1

Hmgn3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn3Q9DCB1 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmgn3Q9DCB1 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmgn3Q9DCB1 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmgn3Q9DCB1 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmgn3Q9DCB1 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmgn3Q9DCB1 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmgn3Q9DCB1 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmgn3Q9DCB1 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmgn3Q9DCB1 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmgn3Q9DCB1 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmgn3Q9DCB1 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmgn3Q9DCB1 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmgn3Q9DCB1 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmgn3Q9DCB1 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmgn3Q9DCB1 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmgn3Q9DCB1 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmgn3Q9DCB1 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmgn3Q9DCB1 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmgn3Q9DCB1 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmgn3Q9DCB1 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmgn3Q9DCB1 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmgn3Q9DCB1 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hmgn3Q9DCB1 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hmgn3Q9DCB1 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hmgn3Q9DCB1 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hmgn3Q9DCB1 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hmgn3Q9DCB1 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hmgn3Q9DCB1 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hmgn3Q9DCB1 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hmgn3Q9DCB1 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hmgn3Q9DCB1 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hmgn3Q9DCB1 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hmgn3Q9DCB1 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hmgn3Q9DCB1 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hmgn3Q9DCB1 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hmgn3Q9DCB1 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hmgn3Q9DCB1 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Hmgn3Q9DCB1 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hmgn3Q9DCB1 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hmgn3Q9DCB1 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hmgn3Q9DCB1 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hmgn3Q9DCB1 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hmgn3Q9DCB1 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hmgn3Q9DCB1 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hmgn3Q9DCB1 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hmgn3Q9DCB1 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hmgn3Q9DCB1 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hmgn3Q9DCB1 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hmgn3Q9DCB1 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hmgn3Q9DCB1 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hmgn3Q9DCB1 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hmgn3Q9DCB1 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hmgn3Q9DCB1 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hmgn3Q9DCB1 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hmgn3Q9DCB1 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hmgn3Q9DCB1 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hmgn3Q9DCB1 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmgn3Q9DCB1 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmgn3Q9DCB1 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmgn3Q9DCB1 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmgn3Q9DCB1 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmgn3Q9DCB1 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmgn3Q9DCB1 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmgn3Q9DCB1 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmgn3Q9DCB1 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmgn3Q9DCB1 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmgn3Q9DCB1 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmgn3Q9DCB1 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmgn3Q9DCB1 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmgn3Q9DCB1 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmgn3Q9DCB1 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmgn3Q9DCB1 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmgn3Q9DCB1 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmgn3Q9DCB1 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmgn3Q9DCB1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmgn3Q9DCB1 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmgn3Q9DCB1 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmgn3Q9DCB1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmgn3Q9DCB1 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmgn3Q9DCB1 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmgn3Q9DCB1 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmgn3Q9DCB1 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmgn3Q9DCB1 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmgn3Q9DCB1 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmgn3Q9DCB1 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmgn3Q9DCB1 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmgn3Q9DCB1 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmgn3Q9DCB1 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmgn3Q9DCB1 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmgn3Q9DCB1 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hmgn3Q9DCB1 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hmgn3Q9DCB1 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hmgn3Q9DCB1 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hmgn3Q9DCB1 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hmgn3Q9DCB1 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hmgn3Q9DCB1 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hmgn3Q9DCB1 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hmgn3Q9DCB1 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hmgn3Q9DCB1 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hmgn3Q9DCB1 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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