Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syde1Q9DBZ9 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syde1Q9DBZ9 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syde1Q9DBZ9 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syde1Q9DBZ9 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syde1Q9DBZ9 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syde1Q9DBZ9 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syde1Q9DBZ9 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syde1Q9DBZ9 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syde1Q9DBZ9 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syde1Q9DBZ9 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syde1Q9DBZ9 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syde1Q9DBZ9 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syde1Q9DBZ9 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syde1Q9DBZ9 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syde1Q9DBZ9 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syde1Q9DBZ9 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syde1Q9DBZ9 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syde1Q9DBZ9 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syde1Q9DBZ9 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syde1Q9DBZ9 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syde1Q9DBZ9 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syde1Q9DBZ9 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syde1Q9DBZ9 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Syde1Q9DBZ9 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syde1Q9DBZ9 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syde1Q9DBZ9 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syde1Q9DBZ9 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syde1Q9DBZ9 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syde1Q9DBZ9 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syde1Q9DBZ9 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syde1Q9DBZ9 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syde1Q9DBZ9 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syde1Q9DBZ9 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syde1Q9DBZ9 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syde1Q9DBZ9 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Syde1Q9DBZ9 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syde1Q9DBZ9 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syde1Q9DBZ9 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syde1Q9DBZ9 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syde1Q9DBZ9 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syde1Q9DBZ9 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syde1Q9DBZ9 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syde1Q9DBZ9 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syde1Q9DBZ9 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syde1Q9DBZ9 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syde1Q9DBZ9 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syde1Q9DBZ9 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syde1Q9DBZ9 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syde1Q9DBZ9 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syde1Q9DBZ9 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Syde1Q9DBZ9 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Syde1Q9DBZ9 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Syde1Q9DBZ9 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syde1Q9DBZ9 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syde1Q9DBZ9 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syde1Q9DBZ9 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syde1Q9DBZ9 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syde1Q9DBZ9 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syde1Q9DBZ9 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syde1Q9DBZ9 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syde1Q9DBZ9 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syde1Q9DBZ9 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syde1Q9DBZ9 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syde1Q9DBZ9 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syde1Q9DBZ9 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syde1Q9DBZ9 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syde1Q9DBZ9 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syde1Q9DBZ9 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syde1Q9DBZ9 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syde1Q9DBZ9 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syde1Q9DBZ9 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syde1Q9DBZ9 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syde1Q9DBZ9 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Syde1Q9DBZ9 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Syde1Q9DBZ9 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Syde1Q9DBZ9 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Syde1Q9DBZ9 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Syde1Q9DBZ9 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Syde1Q9DBZ9 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Syde1Q9DBZ9 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Syde1Q9DBZ9 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Syde1Q9DBZ9 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Syde1Q9DBZ9 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Syde1Q9DBZ9 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Syde1Q9DBZ9 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Syde1Q9DBZ9 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Syde1Q9DBZ9 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Syde1Q9DBZ9 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Syde1Q9DBZ9 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syde1Q9DBZ9 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syde1Q9DBZ9 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syde1Q9DBZ9 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syde1Q9DBZ9 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syde1Q9DBZ9 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syde1Q9DBZ9 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syde1Q9DBZ9 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syde1Q9DBZ9 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syde1Q9DBZ9 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syde1Q9DBZ9 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms