Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 AC154683.1-201ENSMUST00000228409 1284 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 Gm37517-201ENSMUST00000194004 1289 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 Olfr886-ps1-201ENSMUST00000212395 708 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 AC154730.1-201ENSMUST00000227874 816 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 Vmn1r85-201ENSMUST00000094829 927 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 Klra5-202ENSMUST00000118060 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 Klra5-201ENSMUST00000014683 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 Olfr489-ps1-201ENSMUST00000210404 967 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 AC160061.1-201ENSMUST00000217766 533 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 Vmn1r35-201ENSMUST00000071414 891 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 Zfp865-202ENSMUST00000076791 1129 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 Nme5-201ENSMUST00000079287 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Riok3Q9DBU3 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Riok3Q9DBU3 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Riok3Q9DBU3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Riok3Q9DBU3 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Riok3Q9DBU3 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Riok3Q9DBU3 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Riok3Q9DBU3 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Riok3Q9DBU3 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Riok3Q9DBU3 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Riok3Q9DBU3 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Riok3Q9DBU3 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Riok3Q9DBU3 Gm11656-201ENSMUST00000137462 395 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Riok3Q9DBU3 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Riok3Q9DBU3 Gm21139-201ENSMUST00000186594 877 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Riok3Q9DBU3 Scoc-209ENSMUST00000212905 798 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Riok3Q9DBU3 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Riok3Q9DBU3 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Riok3Q9DBU3 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Riok3Q9DBU3 Olfr845-201ENSMUST00000071259 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Riok3Q9DBU3 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Riok3Q9DBU3 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Riok3Q9DBU3 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Riok3Q9DBU3 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Riok3Q9DBU3 Gm38325-201ENSMUST00000194507 1377 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Riok3Q9DBU3 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Riok3Q9DBU3 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Riok3Q9DBU3 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Riok3Q9DBU3 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Riok3Q9DBU3 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Riok3Q9DBU3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Riok3Q9DBU3 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Riok3Q9DBU3 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Riok3Q9DBU3 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Riok3Q9DBU3 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms