Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBC3

Cmtr1, Cap-specific mRNA (nucleoside-2'-O-)-methyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtr1Q9DBC3 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cmtr1Q9DBC3 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cmtr1Q9DBC3 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cmtr1Q9DBC3 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cmtr1Q9DBC3 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cmtr1Q9DBC3 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cmtr1Q9DBC3 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cmtr1Q9DBC3 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cmtr1Q9DBC3 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cmtr1Q9DBC3 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cmtr1Q9DBC3 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cmtr1Q9DBC3 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cmtr1Q9DBC3 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cmtr1Q9DBC3 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cmtr1Q9DBC3 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cmtr1Q9DBC3 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cmtr1Q9DBC3 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cmtr1Q9DBC3 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cmtr1Q9DBC3 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cmtr1Q9DBC3 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cmtr1Q9DBC3 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cmtr1Q9DBC3 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cmtr1Q9DBC3 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cmtr1Q9DBC3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cmtr1Q9DBC3 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cmtr1Q9DBC3 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cmtr1Q9DBC3 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cmtr1Q9DBC3 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cmtr1Q9DBC3 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cmtr1Q9DBC3 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cmtr1Q9DBC3 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cmtr1Q9DBC3 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cmtr1Q9DBC3 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cmtr1Q9DBC3 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cmtr1Q9DBC3 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cmtr1Q9DBC3 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cmtr1Q9DBC3 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cmtr1Q9DBC3 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cmtr1Q9DBC3 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cmtr1Q9DBC3 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cmtr1Q9DBC3 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cmtr1Q9DBC3 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cmtr1Q9DBC3 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cmtr1Q9DBC3 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cmtr1Q9DBC3 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cmtr1Q9DBC3 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cmtr1Q9DBC3 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cmtr1Q9DBC3 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cmtr1Q9DBC3 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cmtr1Q9DBC3 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cmtr1Q9DBC3 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cmtr1Q9DBC3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cmtr1Q9DBC3 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cmtr1Q9DBC3 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cmtr1Q9DBC3 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cmtr1Q9DBC3 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cmtr1Q9DBC3 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cmtr1Q9DBC3 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cmtr1Q9DBC3 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cmtr1Q9DBC3 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cmtr1Q9DBC3 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cmtr1Q9DBC3 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cmtr1Q9DBC3 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cmtr1Q9DBC3 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cmtr1Q9DBC3 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cmtr1Q9DBC3 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cmtr1Q9DBC3 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cmtr1Q9DBC3 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cmtr1Q9DBC3 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cmtr1Q9DBC3 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cmtr1Q9DBC3 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cmtr1Q9DBC3 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cmtr1Q9DBC3 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cmtr1Q9DBC3 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cmtr1Q9DBC3 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cmtr1Q9DBC3 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cmtr1Q9DBC3 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cmtr1Q9DBC3 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cmtr1Q9DBC3 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cmtr1Q9DBC3 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cmtr1Q9DBC3 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cmtr1Q9DBC3 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cmtr1Q9DBC3 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cmtr1Q9DBC3 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cmtr1Q9DBC3 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cmtr1Q9DBC3 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cmtr1Q9DBC3 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cmtr1Q9DBC3 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cmtr1Q9DBC3 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cmtr1Q9DBC3 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cmtr1Q9DBC3 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cmtr1Q9DBC3 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cmtr1Q9DBC3 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cmtr1Q9DBC3 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cmtr1Q9DBC3 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cmtr1Q9DBC3 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cmtr1Q9DBC3 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cmtr1Q9DBC3 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cmtr1Q9DBC3 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cmtr1Q9DBC3 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms