Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp12Q9D9M2 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp12Q9D9M2 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp12Q9D9M2 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp12Q9D9M2 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp12Q9D9M2 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp12Q9D9M2 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp12Q9D9M2 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp12Q9D9M2 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp12Q9D9M2 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp12Q9D9M2 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp12Q9D9M2 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp12Q9D9M2 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp12Q9D9M2 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp12Q9D9M2 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp12Q9D9M2 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp12Q9D9M2 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp12Q9D9M2 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp12Q9D9M2 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp12Q9D9M2 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp12Q9D9M2 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp12Q9D9M2 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp12Q9D9M2 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp12Q9D9M2 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp12Q9D9M2 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp12Q9D9M2 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp12Q9D9M2 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp12Q9D9M2 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp12Q9D9M2 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp12Q9D9M2 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp12Q9D9M2 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp12Q9D9M2 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp12Q9D9M2 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp12Q9D9M2 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp12Q9D9M2 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp12Q9D9M2 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp12Q9D9M2 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp12Q9D9M2 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp12Q9D9M2 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp12Q9D9M2 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Usp12Q9D9M2 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp12Q9D9M2 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp12Q9D9M2 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp12Q9D9M2 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp12Q9D9M2 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Usp12Q9D9M2 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Usp12Q9D9M2 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Usp12Q9D9M2 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Usp12Q9D9M2 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp12Q9D9M2 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp12Q9D9M2 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Usp12Q9D9M2 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp12Q9D9M2 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp12Q9D9M2 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp12Q9D9M2 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp12Q9D9M2 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp12Q9D9M2 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp12Q9D9M2 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp12Q9D9M2 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp12Q9D9M2 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp12Q9D9M2 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp12Q9D9M2 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp12Q9D9M2 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp12Q9D9M2 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp12Q9D9M2 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp12Q9D9M2 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp12Q9D9M2 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp12Q9D9M2 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp12Q9D9M2 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp12Q9D9M2 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp12Q9D9M2 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp12Q9D9M2 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp12Q9D9M2 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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