Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9H8

UPF0565 protein C2orf69 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D9H8 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Q9D9H8 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q9D9H8 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q9D9H8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q9D9H8 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q9D9H8 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q9D9H8 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q9D9H8 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q9D9H8 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q9D9H8 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q9D9H8 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q9D9H8 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q9D9H8 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Q9D9H8 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q9D9H8 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q9D9H8 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q9D9H8 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q9D9H8 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q9D9H8 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q9D9H8 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q9D9H8 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q9D9H8 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q9D9H8 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q9D9H8 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q9D9H8 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q9D9H8 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q9D9H8 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q9D9H8 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q9D9H8 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q9D9H8 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q9D9H8 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q9D9H8 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Q9D9H8 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q9D9H8 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q9D9H8 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q9D9H8 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q9D9H8 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q9D9H8 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q9D9H8 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q9D9H8 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Q9D9H8 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Q9D9H8 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Q9D9H8 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Q9D9H8 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Q9D9H8 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Q9D9H8 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Q9D9H8 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Q9D9H8 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Q9D9H8 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Q9D9H8 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Q9D9H8 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Q9D9H8 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Q9D9H8 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Q9D9H8 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Q9D9H8 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Q9D9H8 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Q9D9H8 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Q9D9H8 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Q9D9H8 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Q9D9H8 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Q9D9H8 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Q9D9H8 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q9D9H8 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q9D9H8 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q9D9H8 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q9D9H8 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q9D9H8 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q9D9H8 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q9D9H8 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q9D9H8 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Q9D9H8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q9D9H8 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q9D9H8 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q9D9H8 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q9D9H8 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Q9D9H8 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q9D9H8 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q9D9H8 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Q9D9H8 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q9D9H8 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q9D9H8 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q9D9H8 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q9D9H8 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q9D9H8 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q9D9H8 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q9D9H8 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q9D9H8 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q9D9H8 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q9D9H8 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q9D9H8 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q9D9H8 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q9D9H8 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q9D9H8 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q9D9H8 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q9D9H8 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q9D9H8 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q9D9H8 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q9D9H8 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q9D9H8 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q9D9H8 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms