Protein–RNA interactions for Protein: Q9D995

Cntd1, Cyclin N-terminal domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntd1Q9D995 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cntd1Q9D995 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cntd1Q9D995 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cntd1Q9D995 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cntd1Q9D995 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cntd1Q9D995 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cntd1Q9D995 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cntd1Q9D995 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cntd1Q9D995 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cntd1Q9D995 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cntd1Q9D995 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cntd1Q9D995 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cntd1Q9D995 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cntd1Q9D995 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cntd1Q9D995 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cntd1Q9D995 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cntd1Q9D995 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cntd1Q9D995 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cntd1Q9D995 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cntd1Q9D995 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cntd1Q9D995 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cntd1Q9D995 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cntd1Q9D995 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cntd1Q9D995 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cntd1Q9D995 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cntd1Q9D995 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cntd1Q9D995 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cntd1Q9D995 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cntd1Q9D995 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cntd1Q9D995 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cntd1Q9D995 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cntd1Q9D995 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cntd1Q9D995 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cntd1Q9D995 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cntd1Q9D995 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cntd1Q9D995 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cntd1Q9D995 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cntd1Q9D995 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cntd1Q9D995 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cntd1Q9D995 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms