Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnot8Q9D8X5 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnot8Q9D8X5 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnot8Q9D8X5 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnot8Q9D8X5 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnot8Q9D8X5 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnot8Q9D8X5 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnot8Q9D8X5 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnot8Q9D8X5 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnot8Q9D8X5 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnot8Q9D8X5 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnot8Q9D8X5 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnot8Q9D8X5 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnot8Q9D8X5 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnot8Q9D8X5 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnot8Q9D8X5 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnot8Q9D8X5 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnot8Q9D8X5 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnot8Q9D8X5 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnot8Q9D8X5 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnot8Q9D8X5 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnot8Q9D8X5 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnot8Q9D8X5 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnot8Q9D8X5 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnot8Q9D8X5 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnot8Q9D8X5 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnot8Q9D8X5 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnot8Q9D8X5 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnot8Q9D8X5 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnot8Q9D8X5 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnot8Q9D8X5 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnot8Q9D8X5 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnot8Q9D8X5 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnot8Q9D8X5 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnot8Q9D8X5 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnot8Q9D8X5 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnot8Q9D8X5 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnot8Q9D8X5 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnot8Q9D8X5 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnot8Q9D8X5 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnot8Q9D8X5 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnot8Q9D8X5 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnot8Q9D8X5 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnot8Q9D8X5 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnot8Q9D8X5 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnot8Q9D8X5 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnot8Q9D8X5 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnot8Q9D8X5 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnot8Q9D8X5 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnot8Q9D8X5 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnot8Q9D8X5 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnot8Q9D8X5 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnot8Q9D8X5 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnot8Q9D8X5 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnot8Q9D8X5 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnot8Q9D8X5 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnot8Q9D8X5 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnot8Q9D8X5 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnot8Q9D8X5 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnot8Q9D8X5 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnot8Q9D8X5 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnot8Q9D8X5 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnot8Q9D8X5 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnot8Q9D8X5 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnot8Q9D8X5 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnot8Q9D8X5 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnot8Q9D8X5 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnot8Q9D8X5 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnot8Q9D8X5 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnot8Q9D8X5 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnot8Q9D8X5 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnot8Q9D8X5 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnot8Q9D8X5 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnot8Q9D8X5 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnot8Q9D8X5 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnot8Q9D8X5 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnot8Q9D8X5 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnot8Q9D8X5 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnot8Q9D8X5 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnot8Q9D8X5 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnot8Q9D8X5 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnot8Q9D8X5 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnot8Q9D8X5 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnot8Q9D8X5 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnot8Q9D8X5 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnot8Q9D8X5 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnot8Q9D8X5 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnot8Q9D8X5 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnot8Q9D8X5 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnot8Q9D8X5 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnot8Q9D8X5 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnot8Q9D8X5 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnot8Q9D8X5 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnot8Q9D8X5 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnot8Q9D8X5 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnot8Q9D8X5 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnot8Q9D8X5 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cnot8Q9D8X5 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cnot8Q9D8X5 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cnot8Q9D8X5 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms