Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T4

Tvp23b, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tvp23bQ9D8T4 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tvp23bQ9D8T4 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tvp23bQ9D8T4 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tvp23bQ9D8T4 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tvp23bQ9D8T4 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tvp23bQ9D8T4 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tvp23bQ9D8T4 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tvp23bQ9D8T4 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tvp23bQ9D8T4 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tvp23bQ9D8T4 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tvp23bQ9D8T4 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tvp23bQ9D8T4 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tvp23bQ9D8T4 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tvp23bQ9D8T4 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tvp23bQ9D8T4 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tvp23bQ9D8T4 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tvp23bQ9D8T4 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tvp23bQ9D8T4 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tvp23bQ9D8T4 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tvp23bQ9D8T4 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tvp23bQ9D8T4 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tvp23bQ9D8T4 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tvp23bQ9D8T4 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tvp23bQ9D8T4 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tvp23bQ9D8T4 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tvp23bQ9D8T4 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tvp23bQ9D8T4 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tvp23bQ9D8T4 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tvp23bQ9D8T4 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tvp23bQ9D8T4 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tvp23bQ9D8T4 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tvp23bQ9D8T4 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tvp23bQ9D8T4 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tvp23bQ9D8T4 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tvp23bQ9D8T4 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tvp23bQ9D8T4 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tvp23bQ9D8T4 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tvp23bQ9D8T4 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tvp23bQ9D8T4 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tvp23bQ9D8T4 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tvp23bQ9D8T4 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tvp23bQ9D8T4 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tvp23bQ9D8T4 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tvp23bQ9D8T4 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tvp23bQ9D8T4 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tvp23bQ9D8T4 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tvp23bQ9D8T4 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tvp23bQ9D8T4 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tvp23bQ9D8T4 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tvp23bQ9D8T4 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tvp23bQ9D8T4 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tvp23bQ9D8T4 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tvp23bQ9D8T4 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tvp23bQ9D8T4 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tvp23bQ9D8T4 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tvp23bQ9D8T4 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tvp23bQ9D8T4 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tvp23bQ9D8T4 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tvp23bQ9D8T4 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tvp23bQ9D8T4 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tvp23bQ9D8T4 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tvp23bQ9D8T4 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tvp23bQ9D8T4 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tvp23bQ9D8T4 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tvp23bQ9D8T4 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tvp23bQ9D8T4 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tvp23bQ9D8T4 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tvp23bQ9D8T4 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tvp23bQ9D8T4 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tvp23bQ9D8T4 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tvp23bQ9D8T4 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tvp23bQ9D8T4 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tvp23bQ9D8T4 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tvp23bQ9D8T4 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tvp23bQ9D8T4 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tvp23bQ9D8T4 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tvp23bQ9D8T4 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tvp23bQ9D8T4 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tvp23bQ9D8T4 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tvp23bQ9D8T4 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tvp23bQ9D8T4 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tvp23bQ9D8T4 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tvp23bQ9D8T4 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tvp23bQ9D8T4 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tvp23bQ9D8T4 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tvp23bQ9D8T4 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tvp23bQ9D8T4 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tvp23bQ9D8T4 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tvp23bQ9D8T4 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tvp23bQ9D8T4 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tvp23bQ9D8T4 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tvp23bQ9D8T4 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tvp23bQ9D8T4 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tvp23bQ9D8T4 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tvp23bQ9D8T4 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tvp23bQ9D8T4 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tvp23bQ9D8T4 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tvp23bQ9D8T4 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tvp23bQ9D8T4 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tvp23bQ9D8T4 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms