Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf3c6Q9D8P7 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf3c6Q9D8P7 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf3c6Q9D8P7 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf3c6Q9D8P7 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf3c6Q9D8P7 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf3c6Q9D8P7 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf3c6Q9D8P7 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf3c6Q9D8P7 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf3c6Q9D8P7 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf3c6Q9D8P7 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf3c6Q9D8P7 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf3c6Q9D8P7 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf3c6Q9D8P7 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf3c6Q9D8P7 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf3c6Q9D8P7 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf3c6Q9D8P7 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf3c6Q9D8P7 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf3c6Q9D8P7 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf3c6Q9D8P7 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf3c6Q9D8P7 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf3c6Q9D8P7 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf3c6Q9D8P7 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf3c6Q9D8P7 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf3c6Q9D8P7 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf3c6Q9D8P7 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf3c6Q9D8P7 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf3c6Q9D8P7 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf3c6Q9D8P7 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf3c6Q9D8P7 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf3c6Q9D8P7 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf3c6Q9D8P7 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf3c6Q9D8P7 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf3c6Q9D8P7 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf3c6Q9D8P7 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf3c6Q9D8P7 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf3c6Q9D8P7 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf3c6Q9D8P7 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf3c6Q9D8P7 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf3c6Q9D8P7 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf3c6Q9D8P7 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf3c6Q9D8P7 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf3c6Q9D8P7 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf3c6Q9D8P7 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf3c6Q9D8P7 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf3c6Q9D8P7 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf3c6Q9D8P7 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf3c6Q9D8P7 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf3c6Q9D8P7 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf3c6Q9D8P7 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf3c6Q9D8P7 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf3c6Q9D8P7 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf3c6Q9D8P7 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf3c6Q9D8P7 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf3c6Q9D8P7 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf3c6Q9D8P7 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf3c6Q9D8P7 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf3c6Q9D8P7 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf3c6Q9D8P7 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf3c6Q9D8P7 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf3c6Q9D8P7 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf3c6Q9D8P7 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf3c6Q9D8P7 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf3c6Q9D8P7 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf3c6Q9D8P7 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf3c6Q9D8P7 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf3c6Q9D8P7 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf3c6Q9D8P7 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf3c6Q9D8P7 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf3c6Q9D8P7 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf3c6Q9D8P7 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf3c6Q9D8P7 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf3c6Q9D8P7 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf3c6Q9D8P7 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf3c6Q9D8P7 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf3c6Q9D8P7 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf3c6Q9D8P7 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf3c6Q9D8P7 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf3c6Q9D8P7 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf3c6Q9D8P7 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf3c6Q9D8P7 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf3c6Q9D8P7 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf3c6Q9D8P7 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf3c6Q9D8P7 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf3c6Q9D8P7 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf3c6Q9D8P7 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf3c6Q9D8P7 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf3c6Q9D8P7 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Gtf3c6Q9D8P7 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtf3c6Q9D8P7 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtf3c6Q9D8P7 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtf3c6Q9D8P7 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms