Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Chmp4bQ9D8B3 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Chmp4bQ9D8B3 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Chmp4bQ9D8B3 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Chmp4bQ9D8B3 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Chmp4bQ9D8B3 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Chmp4bQ9D8B3 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Chmp4bQ9D8B3 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Chmp4bQ9D8B3 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Chmp4bQ9D8B3 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chmp4bQ9D8B3 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Chmp4bQ9D8B3 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chmp4bQ9D8B3 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chmp4bQ9D8B3 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chmp4bQ9D8B3 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chmp4bQ9D8B3 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chmp4bQ9D8B3 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chmp4bQ9D8B3 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chmp4bQ9D8B3 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chmp4bQ9D8B3 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chmp4bQ9D8B3 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chmp4bQ9D8B3 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chmp4bQ9D8B3 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chmp4bQ9D8B3 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chmp4bQ9D8B3 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chmp4bQ9D8B3 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chmp4bQ9D8B3 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chmp4bQ9D8B3 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chmp4bQ9D8B3 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chmp4bQ9D8B3 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chmp4bQ9D8B3 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Chmp4bQ9D8B3 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Chmp4bQ9D8B3 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Chmp4bQ9D8B3 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Chmp4bQ9D8B3 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Chmp4bQ9D8B3 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Chmp4bQ9D8B3 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Chmp4bQ9D8B3 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Chmp4bQ9D8B3 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Chmp4bQ9D8B3 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Chmp4bQ9D8B3 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Chmp4bQ9D8B3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Chmp4bQ9D8B3 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Chmp4bQ9D8B3 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Chmp4bQ9D8B3 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Chmp4bQ9D8B3 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Chmp4bQ9D8B3 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Chmp4bQ9D8B3 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Chmp4bQ9D8B3 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Chmp4bQ9D8B3 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Chmp4bQ9D8B3 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Chmp4bQ9D8B3 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Chmp4bQ9D8B3 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Chmp4bQ9D8B3 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Chmp4bQ9D8B3 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Chmp4bQ9D8B3 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Chmp4bQ9D8B3 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Chmp4bQ9D8B3 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Chmp4bQ9D8B3 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Chmp4bQ9D8B3 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Chmp4bQ9D8B3 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Chmp4bQ9D8B3 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Chmp4bQ9D8B3 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Chmp4bQ9D8B3 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Chmp4bQ9D8B3 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Chmp4bQ9D8B3 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Chmp4bQ9D8B3 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Chmp4bQ9D8B3 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Chmp4bQ9D8B3 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Chmp4bQ9D8B3 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Chmp4bQ9D8B3 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Chmp4bQ9D8B3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Chmp4bQ9D8B3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Chmp4bQ9D8B3 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Chmp4bQ9D8B3 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Chmp4bQ9D8B3 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Chmp4bQ9D8B3 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Chmp4bQ9D8B3 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Chmp4bQ9D8B3 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Chmp4bQ9D8B3 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Chmp4bQ9D8B3 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Chmp4bQ9D8B3 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Chmp4bQ9D8B3 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Chmp4bQ9D8B3 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Chmp4bQ9D8B3 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Chmp4bQ9D8B3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Chmp4bQ9D8B3 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Chmp4bQ9D8B3 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Chmp4bQ9D8B3 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Chmp4bQ9D8B3 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Chmp4bQ9D8B3 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Chmp4bQ9D8B3 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Chmp4bQ9D8B3 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Chmp4bQ9D8B3 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Chmp4bQ9D8B3 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Chmp4bQ9D8B3 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Chmp4bQ9D8B3 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Chmp4bQ9D8B3 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Chmp4bQ9D8B3 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Chmp4bQ9D8B3 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms