Protein–RNA interactions for Protein: Q9D816

Cyp2c55, Cytochrome P450 2C55, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2c55Q9D816 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyp2c55Q9D816 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyp2c55Q9D816 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cyp2c55Q9D816 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cyp2c55Q9D816 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cyp2c55Q9D816 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cyp2c55Q9D816 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cyp2c55Q9D816 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cyp2c55Q9D816 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cyp2c55Q9D816 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cyp2c55Q9D816 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cyp2c55Q9D816 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cyp2c55Q9D816 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cyp2c55Q9D816 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Cyp2c55Q9D816 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Cyp2c55Q9D816 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cyp2c55Q9D816 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cyp2c55Q9D816 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cyp2c55Q9D816 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cyp2c55Q9D816 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cyp2c55Q9D816 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cyp2c55Q9D816 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cyp2c55Q9D816 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cyp2c55Q9D816 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cyp2c55Q9D816 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cyp2c55Q9D816 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cyp2c55Q9D816 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cyp2c55Q9D816 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cyp2c55Q9D816 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cyp2c55Q9D816 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cyp2c55Q9D816 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cyp2c55Q9D816 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cyp2c55Q9D816 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cyp2c55Q9D816 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cyp2c55Q9D816 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cyp2c55Q9D816 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cyp2c55Q9D816 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cyp2c55Q9D816 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cyp2c55Q9D816 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cyp2c55Q9D816 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cyp2c55Q9D816 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cyp2c55Q9D816 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cyp2c55Q9D816 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cyp2c55Q9D816 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cyp2c55Q9D816 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cyp2c55Q9D816 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cyp2c55Q9D816 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cyp2c55Q9D816 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cyp2c55Q9D816 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cyp2c55Q9D816 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cyp2c55Q9D816 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cyp2c55Q9D816 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cyp2c55Q9D816 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cyp2c55Q9D816 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cyp2c55Q9D816 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cyp2c55Q9D816 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cyp2c55Q9D816 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cyp2c55Q9D816 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cyp2c55Q9D816 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cyp2c55Q9D816 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Cyp2c55Q9D816 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cyp2c55Q9D816 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cyp2c55Q9D816 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cyp2c55Q9D816 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cyp2c55Q9D816 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cyp2c55Q9D816 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cyp2c55Q9D816 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Cyp2c55Q9D816 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Cyp2c55Q9D816 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cyp2c55Q9D816 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cyp2c55Q9D816 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cyp2c55Q9D816 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cyp2c55Q9D816 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cyp2c55Q9D816 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cyp2c55Q9D816 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cyp2c55Q9D816 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cyp2c55Q9D816 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cyp2c55Q9D816 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cyp2c55Q9D816 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cyp2c55Q9D816 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cyp2c55Q9D816 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Cyp2c55Q9D816 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cyp2c55Q9D816 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cyp2c55Q9D816 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cyp2c55Q9D816 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cyp2c55Q9D816 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cyp2c55Q9D816 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cyp2c55Q9D816 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cyp2c55Q9D816 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Cyp2c55Q9D816 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cyp2c55Q9D816 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cyp2c55Q9D816 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cyp2c55Q9D816 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cyp2c55Q9D816 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cyp2c55Q9D816 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cyp2c55Q9D816 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cyp2c55Q9D816 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cyp2c55Q9D816 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cyp2c55Q9D816 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Cyp2c55Q9D816 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms