Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6G9

Cmtm5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm5Q9D6G9 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cmtm5Q9D6G9 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cmtm5Q9D6G9 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cmtm5Q9D6G9 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Cmtm5Q9D6G9 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Cmtm5Q9D6G9 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Cmtm5Q9D6G9 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Cmtm5Q9D6G9 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Cmtm5Q9D6G9 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Cmtm5Q9D6G9 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cmtm5Q9D6G9 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Cmtm5Q9D6G9 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cmtm5Q9D6G9 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cmtm5Q9D6G9 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cmtm5Q9D6G9 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cmtm5Q9D6G9 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cmtm5Q9D6G9 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cmtm5Q9D6G9 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cmtm5Q9D6G9 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cmtm5Q9D6G9 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cmtm5Q9D6G9 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cmtm5Q9D6G9 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cmtm5Q9D6G9 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cmtm5Q9D6G9 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cmtm5Q9D6G9 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cmtm5Q9D6G9 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cmtm5Q9D6G9 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cmtm5Q9D6G9 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cmtm5Q9D6G9 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cmtm5Q9D6G9 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Cmtm5Q9D6G9 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cmtm5Q9D6G9 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cmtm5Q9D6G9 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cmtm5Q9D6G9 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cmtm5Q9D6G9 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Cmtm5Q9D6G9 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cmtm5Q9D6G9 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cmtm5Q9D6G9 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cmtm5Q9D6G9 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cmtm5Q9D6G9 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cmtm5Q9D6G9 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cmtm5Q9D6G9 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cmtm5Q9D6G9 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cmtm5Q9D6G9 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cmtm5Q9D6G9 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cmtm5Q9D6G9 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Cmtm5Q9D6G9 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cmtm5Q9D6G9 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cmtm5Q9D6G9 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cmtm5Q9D6G9 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cmtm5Q9D6G9 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cmtm5Q9D6G9 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cmtm5Q9D6G9 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cmtm5Q9D6G9 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cmtm5Q9D6G9 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cmtm5Q9D6G9 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cmtm5Q9D6G9 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cmtm5Q9D6G9 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cmtm5Q9D6G9 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cmtm5Q9D6G9 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cmtm5Q9D6G9 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cmtm5Q9D6G9 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cmtm5Q9D6G9 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cmtm5Q9D6G9 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cmtm5Q9D6G9 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cmtm5Q9D6G9 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cmtm5Q9D6G9 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cmtm5Q9D6G9 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cmtm5Q9D6G9 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cmtm5Q9D6G9 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cmtm5Q9D6G9 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cmtm5Q9D6G9 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Cmtm5Q9D6G9 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cmtm5Q9D6G9 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Cmtm5Q9D6G9 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cmtm5Q9D6G9 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cmtm5Q9D6G9 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cmtm5Q9D6G9 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cmtm5Q9D6G9 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cmtm5Q9D6G9 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cmtm5Q9D6G9 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cmtm5Q9D6G9 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cmtm5Q9D6G9 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cmtm5Q9D6G9 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cmtm5Q9D6G9 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cmtm5Q9D6G9 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cmtm5Q9D6G9 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cmtm5Q9D6G9 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cmtm5Q9D6G9 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cmtm5Q9D6G9 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cmtm5Q9D6G9 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cmtm5Q9D6G9 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cmtm5Q9D6G9 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Cmtm5Q9D6G9 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cmtm5Q9D6G9 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cmtm5Q9D6G9 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cmtm5Q9D6G9 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cmtm5Q9D6G9 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cmtm5Q9D6G9 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Cmtm5Q9D6G9 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms