Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5W4

Ccdc81, Coiled-coil domain-containing protein 81, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc81Q9D5W4 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc81Q9D5W4 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc81Q9D5W4 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc81Q9D5W4 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc81Q9D5W4 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc81Q9D5W4 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc81Q9D5W4 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc81Q9D5W4 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc81Q9D5W4 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc81Q9D5W4 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc81Q9D5W4 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc81Q9D5W4 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc81Q9D5W4 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc81Q9D5W4 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc81Q9D5W4 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc81Q9D5W4 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc81Q9D5W4 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc81Q9D5W4 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc81Q9D5W4 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc81Q9D5W4 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc81Q9D5W4 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc81Q9D5W4 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc81Q9D5W4 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc81Q9D5W4 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc81Q9D5W4 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc81Q9D5W4 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc81Q9D5W4 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc81Q9D5W4 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc81Q9D5W4 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc81Q9D5W4 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc81Q9D5W4 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc81Q9D5W4 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc81Q9D5W4 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc81Q9D5W4 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc81Q9D5W4 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc81Q9D5W4 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc81Q9D5W4 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc81Q9D5W4 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc81Q9D5W4 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc81Q9D5W4 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc81Q9D5W4 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc81Q9D5W4 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc81Q9D5W4 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc81Q9D5W4 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc81Q9D5W4 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc81Q9D5W4 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc81Q9D5W4 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc81Q9D5W4 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc81Q9D5W4 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc81Q9D5W4 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc81Q9D5W4 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc81Q9D5W4 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc81Q9D5W4 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc81Q9D5W4 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc81Q9D5W4 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc81Q9D5W4 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc81Q9D5W4 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc81Q9D5W4 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc81Q9D5W4 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc81Q9D5W4 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc81Q9D5W4 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc81Q9D5W4 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc81Q9D5W4 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc81Q9D5W4 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc81Q9D5W4 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc81Q9D5W4 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc81Q9D5W4 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc81Q9D5W4 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc81Q9D5W4 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc81Q9D5W4 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc81Q9D5W4 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc81Q9D5W4 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc81Q9D5W4 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc81Q9D5W4 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc81Q9D5W4 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc81Q9D5W4 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc81Q9D5W4 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc81Q9D5W4 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc81Q9D5W4 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc81Q9D5W4 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc81Q9D5W4 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc81Q9D5W4 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc81Q9D5W4 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc81Q9D5W4 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc81Q9D5W4 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc81Q9D5W4 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc81Q9D5W4 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc81Q9D5W4 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc81Q9D5W4 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc81Q9D5W4 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc81Q9D5W4 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc81Q9D5W4 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc81Q9D5W4 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc81Q9D5W4 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc81Q9D5W4 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc81Q9D5W4 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc81Q9D5W4 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc81Q9D5W4 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc81Q9D5W4 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc81Q9D5W4 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms