Protein–RNA interactions for Protein: Q9D518

Fam227b, Protein FAM227B, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam227bQ9D518 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fam227bQ9D518 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fam227bQ9D518 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fam227bQ9D518 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fam227bQ9D518 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fam227bQ9D518 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fam227bQ9D518 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fam227bQ9D518 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fam227bQ9D518 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fam227bQ9D518 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fam227bQ9D518 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fam227bQ9D518 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fam227bQ9D518 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fam227bQ9D518 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fam227bQ9D518 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fam227bQ9D518 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fam227bQ9D518 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fam227bQ9D518 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fam227bQ9D518 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fam227bQ9D518 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fam227bQ9D518 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fam227bQ9D518 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fam227bQ9D518 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fam227bQ9D518 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fam227bQ9D518 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fam227bQ9D518 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fam227bQ9D518 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Fam227bQ9D518 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Fam227bQ9D518 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Fam227bQ9D518 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Fam227bQ9D518 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Fam227bQ9D518 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Fam227bQ9D518 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Fam227bQ9D518 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Fam227bQ9D518 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Fam227bQ9D518 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fam227bQ9D518 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Fam227bQ9D518 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fam227bQ9D518 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fam227bQ9D518 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fam227bQ9D518 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fam227bQ9D518 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fam227bQ9D518 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fam227bQ9D518 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fam227bQ9D518 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fam227bQ9D518 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fam227bQ9D518 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fam227bQ9D518 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fam227bQ9D518 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fam227bQ9D518 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fam227bQ9D518 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fam227bQ9D518 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fam227bQ9D518 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fam227bQ9D518 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fam227bQ9D518 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fam227bQ9D518 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fam227bQ9D518 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fam227bQ9D518 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fam227bQ9D518 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fam227bQ9D518 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fam227bQ9D518 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fam227bQ9D518 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fam227bQ9D518 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fam227bQ9D518 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fam227bQ9D518 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Fam227bQ9D518 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fam227bQ9D518 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fam227bQ9D518 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fam227bQ9D518 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fam227bQ9D518 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fam227bQ9D518 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fam227bQ9D518 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fam227bQ9D518 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fam227bQ9D518 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fam227bQ9D518 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fam227bQ9D518 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fam227bQ9D518 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fam227bQ9D518 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fam227bQ9D518 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Fam227bQ9D518 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fam227bQ9D518 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fam227bQ9D518 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fam227bQ9D518 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fam227bQ9D518 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Fam227bQ9D518 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fam227bQ9D518 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fam227bQ9D518 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fam227bQ9D518 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fam227bQ9D518 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fam227bQ9D518 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fam227bQ9D518 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fam227bQ9D518 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fam227bQ9D518 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fam227bQ9D518 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fam227bQ9D518 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fam227bQ9D518 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fam227bQ9D518 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fam227bQ9D518 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fam227bQ9D518 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fam227bQ9D518 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms