Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Q4

4930578G10Rik, RIKEN cDNA 4930578G10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930578G10RikQ9D4Q4 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4930578G10RikQ9D4Q4 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
4930578G10RikQ9D4Q4 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4930578G10RikQ9D4Q4 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
4930578G10RikQ9D4Q4 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
4930578G10RikQ9D4Q4 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4930578G10RikQ9D4Q4 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4930578G10RikQ9D4Q4 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4930578G10RikQ9D4Q4 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4930578G10RikQ9D4Q4 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
4930578G10RikQ9D4Q4 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4930578G10RikQ9D4Q4 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930578G10RikQ9D4Q4 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930578G10RikQ9D4Q4 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930578G10RikQ9D4Q4 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930578G10RikQ9D4Q4 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930578G10RikQ9D4Q4 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930578G10RikQ9D4Q4 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930578G10RikQ9D4Q4 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930578G10RikQ9D4Q4 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930578G10RikQ9D4Q4 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930578G10RikQ9D4Q4 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
4930578G10RikQ9D4Q4 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
4930578G10RikQ9D4Q4 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930578G10RikQ9D4Q4 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930578G10RikQ9D4Q4 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930578G10RikQ9D4Q4 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930578G10RikQ9D4Q4 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930578G10RikQ9D4Q4 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930578G10RikQ9D4Q4 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4930578G10RikQ9D4Q4 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4930578G10RikQ9D4Q4 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
4930578G10RikQ9D4Q4 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4930578G10RikQ9D4Q4 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
4930578G10RikQ9D4Q4 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4930578G10RikQ9D4Q4 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4930578G10RikQ9D4Q4 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4930578G10RikQ9D4Q4 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
4930578G10RikQ9D4Q4 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4930578G10RikQ9D4Q4 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4930578G10RikQ9D4Q4 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930578G10RikQ9D4Q4 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
4930578G10RikQ9D4Q4 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930578G10RikQ9D4Q4 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930578G10RikQ9D4Q4 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930578G10RikQ9D4Q4 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930578G10RikQ9D4Q4 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930578G10RikQ9D4Q4 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930578G10RikQ9D4Q4 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930578G10RikQ9D4Q4 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930578G10RikQ9D4Q4 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930578G10RikQ9D4Q4 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
4930578G10RikQ9D4Q4 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930578G10RikQ9D4Q4 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930578G10RikQ9D4Q4 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930578G10RikQ9D4Q4 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930578G10RikQ9D4Q4 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930578G10RikQ9D4Q4 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930578G10RikQ9D4Q4 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4930578G10RikQ9D4Q4 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4930578G10RikQ9D4Q4 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
4930578G10RikQ9D4Q4 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4930578G10RikQ9D4Q4 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4930578G10RikQ9D4Q4 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
4930578G10RikQ9D4Q4 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4930578G10RikQ9D4Q4 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
4930578G10RikQ9D4Q4 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4930578G10RikQ9D4Q4 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4930578G10RikQ9D4Q4 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
4930578G10RikQ9D4Q4 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4930578G10RikQ9D4Q4 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
4930578G10RikQ9D4Q4 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4930578G10RikQ9D4Q4 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4930578G10RikQ9D4Q4 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4930578G10RikQ9D4Q4 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4930578G10RikQ9D4Q4 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4930578G10RikQ9D4Q4 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
4930578G10RikQ9D4Q4 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
4930578G10RikQ9D4Q4 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
4930578G10RikQ9D4Q4 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4930578G10RikQ9D4Q4 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
4930578G10RikQ9D4Q4 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4930578G10RikQ9D4Q4 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4930578G10RikQ9D4Q4 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
4930578G10RikQ9D4Q4 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms