Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J7

Phf6, PHD finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf6Q9D4J7 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Phf6Q9D4J7 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phf6Q9D4J7 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Phf6Q9D4J7 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phf6Q9D4J7 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phf6Q9D4J7 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phf6Q9D4J7 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phf6Q9D4J7 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Phf6Q9D4J7 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Phf6Q9D4J7 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Phf6Q9D4J7 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Phf6Q9D4J7 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Phf6Q9D4J7 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Phf6Q9D4J7 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Phf6Q9D4J7 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Phf6Q9D4J7 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Phf6Q9D4J7 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Phf6Q9D4J7 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Phf6Q9D4J7 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Phf6Q9D4J7 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Phf6Q9D4J7 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Phf6Q9D4J7 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Phf6Q9D4J7 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Phf6Q9D4J7 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Phf6Q9D4J7 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Phf6Q9D4J7 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Phf6Q9D4J7 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Phf6Q9D4J7 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Phf6Q9D4J7 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Phf6Q9D4J7 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Phf6Q9D4J7 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Phf6Q9D4J7 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Phf6Q9D4J7 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Phf6Q9D4J7 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Phf6Q9D4J7 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Phf6Q9D4J7 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Phf6Q9D4J7 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Phf6Q9D4J7 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Phf6Q9D4J7 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Phf6Q9D4J7 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Phf6Q9D4J7 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Phf6Q9D4J7 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Phf6Q9D4J7 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Phf6Q9D4J7 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Phf6Q9D4J7 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Phf6Q9D4J7 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Phf6Q9D4J7 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Phf6Q9D4J7 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Phf6Q9D4J7 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Phf6Q9D4J7 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Phf6Q9D4J7 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Phf6Q9D4J7 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Phf6Q9D4J7 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Phf6Q9D4J7 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Phf6Q9D4J7 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Phf6Q9D4J7 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Phf6Q9D4J7 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Phf6Q9D4J7 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Phf6Q9D4J7 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Phf6Q9D4J7 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Phf6Q9D4J7 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Phf6Q9D4J7 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Phf6Q9D4J7 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Phf6Q9D4J7 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Phf6Q9D4J7 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Phf6Q9D4J7 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Phf6Q9D4J7 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Phf6Q9D4J7 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Phf6Q9D4J7 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Phf6Q9D4J7 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Phf6Q9D4J7 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Phf6Q9D4J7 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Phf6Q9D4J7 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Phf6Q9D4J7 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Phf6Q9D4J7 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Phf6Q9D4J7 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Phf6Q9D4J7 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Phf6Q9D4J7 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Phf6Q9D4J7 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Phf6Q9D4J7 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Phf6Q9D4J7 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Phf6Q9D4J7 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Phf6Q9D4J7 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Phf6Q9D4J7 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Phf6Q9D4J7 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Phf6Q9D4J7 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Phf6Q9D4J7 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Phf6Q9D4J7 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Phf6Q9D4J7 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Phf6Q9D4J7 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Phf6Q9D4J7 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Phf6Q9D4J7 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Phf6Q9D4J7 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Phf6Q9D4J7 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Phf6Q9D4J7 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Phf6Q9D4J7 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Phf6Q9D4J7 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Phf6Q9D4J7 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Phf6Q9D4J7 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Phf6Q9D4J7 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91 ms