Protein–RNA interactions for Protein: Q9D454

Uncharacterized protein CXorf49 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D454 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D454 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D454 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D454 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D454 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D454 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D454 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D454 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D454 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D454 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D454 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D454 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D454 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D454 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D454 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D454 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D454 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D454 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D454 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D454 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D454 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D454 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D454 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D454 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D454 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D454 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D454 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D454 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D454 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D454 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D454 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D454 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D454 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D454 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D454 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D454 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D454 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D454 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D454 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D454 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D454 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D454 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D454 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D454 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D454 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D454 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D454 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D454 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D454 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D454 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D454 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D454 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D454 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D454 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D454 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D454 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D454 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D454 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D454 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D454 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D454 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D454 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D454 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D454 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D454 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D454 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D454 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D454 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9D454 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9D454 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9D454 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9D454 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9D454 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9D454 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9D454 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9D454 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9D454 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9D454 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9D454 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9D454 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9D454 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9D454 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9D454 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9D454 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9D454 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9D454 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9D454 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9D454 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9D454 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q9D454 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q9D454 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q9D454 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q9D454 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q9D454 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q9D454 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q9D454 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q9D454 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9D454 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9D454 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9D454 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms